Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NR1D1P20393 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NR1D1P20393 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NR1D1P20393 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NR1D1P20393 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NR1D1P20393 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NR1D1P20393 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NR1D1P20393 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NR1D1P20393 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NR1D1P20393 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NR1D1P20393 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NR1D1P20393 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NR1D1P20393 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NR1D1P20393 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NR1D1P20393 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NR1D1P20393 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NR1D1P20393 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NR1D1P20393 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NR1D1P20393 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NR1D1P20393 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NR1D1P20393 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NR1D1P20393 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NR1D1P20393 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NR1D1P20393 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NR1D1P20393 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NR1D1P20393 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NR1D1P20393 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NR1D1P20393 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NR1D1P20393 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NR1D1P20393 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NR1D1P20393 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NR1D1P20393 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NR1D1P20393 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NR1D1P20393 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NR1D1P20393 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NR1D1P20393 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NR1D1P20393 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NR1D1P20393 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NR1D1P20393 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NR1D1P20393 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NR1D1P20393 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NR1D1P20393 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NR1D1P20393 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NR1D1P20393 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NR1D1P20393 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NR1D1P20393 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NR1D1P20393 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NR1D1P20393 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NR1D1P20393 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NR1D1P20393 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NR1D1P20393 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NR1D1P20393 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NR1D1P20393 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NR1D1P20393 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NR1D1P20393 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NR1D1P20393 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NR1D1P20393 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NR1D1P20393 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NR1D1P20393 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NR1D1P20393 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NR1D1P20393 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NR1D1P20393 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NR1D1P20393 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NR1D1P20393 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NR1D1P20393 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NR1D1P20393 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NR1D1P20393 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NR1D1P20393 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NR1D1P20393 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NR1D1P20393 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NR1D1P20393 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NR1D1P20393 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NR1D1P20393 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NR1D1P20393 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NR1D1P20393 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NR1D1P20393 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NR1D1P20393 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NR1D1P20393 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NR1D1P20393 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NR1D1P20393 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NR1D1P20393 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NR1D1P20393 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NR1D1P20393 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NR1D1P20393 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NR1D1P20393 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NR1D1P20393 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NR1D1P20393 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NR1D1P20393 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NR1D1P20393 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NR1D1P20393 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NR1D1P20393 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NR1D1P20393 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NR1D1P20393 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NR1D1P20393 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NR1D1P20393 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NR1D1P20393 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NR1D1P20393 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NR1D1P20393 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NR1D1P20393 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NR1D1P20393 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms