Protein–RNA interactions for Protein: P20336

RAB3A, Ras-related protein Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3AP20336 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB3AP20336 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB3AP20336 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB3AP20336 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB3AP20336 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB3AP20336 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB3AP20336 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB3AP20336 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB3AP20336 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB3AP20336 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB3AP20336 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB3AP20336 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB3AP20336 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB3AP20336 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB3AP20336 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB3AP20336 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB3AP20336 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB3AP20336 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB3AP20336 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB3AP20336 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB3AP20336 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB3AP20336 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB3AP20336 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB3AP20336 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB3AP20336 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB3AP20336 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB3AP20336 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB3AP20336 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB3AP20336 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB3AP20336 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB3AP20336 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB3AP20336 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB3AP20336 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB3AP20336 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB3AP20336 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB3AP20336 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB3AP20336 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB3AP20336 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB3AP20336 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB3AP20336 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB3AP20336 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB3AP20336 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAB3AP20336 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB3AP20336 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB3AP20336 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB3AP20336 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB3AP20336 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB3AP20336 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3AP20336 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB3AP20336 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB3AP20336 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB3AP20336 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3AP20336 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB3AP20336 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB3AP20336 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB3AP20336 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB3AP20336 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB3AP20336 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB3AP20336 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB3AP20336 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB3AP20336 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB3AP20336 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3AP20336 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3AP20336 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3AP20336 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3AP20336 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3AP20336 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB3AP20336 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB3AP20336 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB3AP20336 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB3AP20336 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB3AP20336 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB3AP20336 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB3AP20336 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAB3AP20336 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB3AP20336 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB3AP20336 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB3AP20336 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB3AP20336 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB3AP20336 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB3AP20336 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB3AP20336 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB3AP20336 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB3AP20336 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB3AP20336 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB3AP20336 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3AP20336 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3AP20336 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB3AP20336 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB3AP20336 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3AP20336 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3AP20336 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3AP20336 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3AP20336 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB3AP20336 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB3AP20336 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB3AP20336 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB3AP20336 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB3AP20336 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB3AP20336 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms