Protein–RNA interactions for Protein: P19022

CDH2, Cadherin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH2P19022 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDH2P19022 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDH2P19022 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDH2P19022 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDH2P19022 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDH2P19022 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDH2P19022 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDH2P19022 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDH2P19022 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDH2P19022 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDH2P19022 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDH2P19022 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDH2P19022 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDH2P19022 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDH2P19022 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDH2P19022 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDH2P19022 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDH2P19022 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDH2P19022 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDH2P19022 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDH2P19022 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDH2P19022 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDH2P19022 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDH2P19022 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDH2P19022 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDH2P19022 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDH2P19022 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDH2P19022 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDH2P19022 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDH2P19022 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDH2P19022 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH2P19022 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDH2P19022 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDH2P19022 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDH2P19022 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDH2P19022 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDH2P19022 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDH2P19022 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDH2P19022 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDH2P19022 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDH2P19022 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDH2P19022 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CDH2P19022 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDH2P19022 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH2P19022 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH2P19022 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDH2P19022 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDH2P19022 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDH2P19022 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDH2P19022 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH2P19022 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDH2P19022 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDH2P19022 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDH2P19022 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDH2P19022 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDH2P19022 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDH2P19022 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDH2P19022 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CDH2P19022 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDH2P19022 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDH2P19022 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDH2P19022 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDH2P19022 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CDH2P19022 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDH2P19022 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDH2P19022 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDH2P19022 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDH2P19022 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDH2P19022 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDH2P19022 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDH2P19022 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDH2P19022 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDH2P19022 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDH2P19022 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDH2P19022 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDH2P19022 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CDH2P19022 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDH2P19022 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDH2P19022 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDH2P19022 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDH2P19022 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDH2P19022 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDH2P19022 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDH2P19022 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDH2P19022 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDH2P19022 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDH2P19022 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDH2P19022 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDH2P19022 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDH2P19022 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDH2P19022 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDH2P19022 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDH2P19022 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH2P19022 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH2P19022 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDH2P19022 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH2P19022 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH2P19022 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH2P19022 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDH2P19022 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms