Protein–RNA interactions for Protein: P18848

ATF4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF4P18848 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF4P18848 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF4P18848 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF4P18848 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF4P18848 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATF4P18848 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATF4P18848 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF4P18848 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF4P18848 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF4P18848 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF4P18848 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF4P18848 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF4P18848 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATF4P18848 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF4P18848 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF4P18848 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF4P18848 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF4P18848 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF4P18848 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF4P18848 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF4P18848 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF4P18848 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF4P18848 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF4P18848 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF4P18848 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF4P18848 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF4P18848 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF4P18848 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF4P18848 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF4P18848 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF4P18848 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF4P18848 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF4P18848 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF4P18848 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF4P18848 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF4P18848 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF4P18848 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF4P18848 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATF4P18848 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF4P18848 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF4P18848 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF4P18848 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF4P18848 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATF4P18848 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF4P18848 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF4P18848 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF4P18848 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF4P18848 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF4P18848 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF4P18848 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF4P18848 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF4P18848 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF4P18848 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF4P18848 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF4P18848 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF4P18848 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF4P18848 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF4P18848 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF4P18848 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF4P18848 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF4P18848 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF4P18848 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF4P18848 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF4P18848 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF4P18848 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF4P18848 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF4P18848 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF4P18848 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF4P18848 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF4P18848 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF4P18848 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF4P18848 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF4P18848 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF4P18848 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF4P18848 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF4P18848 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF4P18848 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF4P18848 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF4P18848 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF4P18848 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF4P18848 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF4P18848 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF4P18848 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF4P18848 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF4P18848 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF4P18848 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF4P18848 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF4P18848 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF4P18848 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF4P18848 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF4P18848 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF4P18848 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF4P18848 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF4P18848 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF4P18848 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF4P18848 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF4P18848 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF4P18848 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF4P18848 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF4P18848 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms