Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KRT10P13645 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
KRT10P13645 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
KRT10P13645 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KRT10P13645 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KRT10P13645 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KRT10P13645 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KRT10P13645 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KRT10P13645 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KRT10P13645 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KRT10P13645 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KRT10P13645 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
KRT10P13645 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KRT10P13645 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KRT10P13645 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KRT10P13645 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KRT10P13645 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KRT10P13645 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
KRT10P13645 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KRT10P13645 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KRT10P13645 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KRT10P13645 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KRT10P13645 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
KRT10P13645 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
KRT10P13645 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KRT10P13645 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KRT10P13645 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KRT10P13645 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KRT10P13645 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KRT10P13645 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KRT10P13645 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KRT10P13645 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT10P13645 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT10P13645 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KRT10P13645 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KRT10P13645 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KRT10P13645 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KRT10P13645 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KRT10P13645 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KRT10P13645 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KRT10P13645 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KRT10P13645 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KRT10P13645 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KRT10P13645 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KRT10P13645 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
KRT10P13645 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
KRT10P13645 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KRT10P13645 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KRT10P13645 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KRT10P13645 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KRT10P13645 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KRT10P13645 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KRT10P13645 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KRT10P13645 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KRT10P13645 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KRT10P13645 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KRT10P13645 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KRT10P13645 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KRT10P13645 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KRT10P13645 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KRT10P13645 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KRT10P13645 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KRT10P13645 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KRT10P13645 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KRT10P13645 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KRT10P13645 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KRT10P13645 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT10P13645 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT10P13645 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT10P13645 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT10P13645 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
KRT10P13645 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KRT10P13645 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT10P13645 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT10P13645 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KRT10P13645 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KRT10P13645 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KRT10P13645 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KRT10P13645 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KRT10P13645 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT10P13645 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT10P13645 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT10P13645 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT10P13645 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT10P13645 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT10P13645 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT10P13645 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT10P13645 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT10P13645 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KRT10P13645 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KRT10P13645 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
KRT10P13645 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT10P13645 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT10P13645 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
KRT10P13645 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
KRT10P13645 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KRT10P13645 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
KRT10P13645 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KRT10P13645 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KRT10P13645 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms