Protein–RNA interactions for Protein: P0DP71

FAM236C, Protein FAM236C, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM236CP0DP71 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM236CP0DP71 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
FAM236CP0DP71 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM236CP0DP71 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM236CP0DP71 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM236CP0DP71 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM236CP0DP71 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM236CP0DP71 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM236CP0DP71 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM236CP0DP71 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM236CP0DP71 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM236CP0DP71 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM236CP0DP71 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM236CP0DP71 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM236CP0DP71 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM236CP0DP71 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM236CP0DP71 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM236CP0DP71 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM236CP0DP71 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM236CP0DP71 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM236CP0DP71 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM236CP0DP71 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM236CP0DP71 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM236CP0DP71 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM236CP0DP71 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM236CP0DP71 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM236CP0DP71 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM236CP0DP71 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
FAM236CP0DP71 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FAM236CP0DP71 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM236CP0DP71 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM236CP0DP71 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM236CP0DP71 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM236CP0DP71 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM236CP0DP71 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM236CP0DP71 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM236CP0DP71 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM236CP0DP71 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM236CP0DP71 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM236CP0DP71 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM236CP0DP71 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM236CP0DP71 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM236CP0DP71 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM236CP0DP71 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM236CP0DP71 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM236CP0DP71 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM236CP0DP71 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM236CP0DP71 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM236CP0DP71 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM236CP0DP71 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM236CP0DP71 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM236CP0DP71 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM236CP0DP71 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM236CP0DP71 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM236CP0DP71 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM236CP0DP71 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM236CP0DP71 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM236CP0DP71 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM236CP0DP71 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM236CP0DP71 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM236CP0DP71 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM236CP0DP71 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM236CP0DP71 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM236CP0DP71 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM236CP0DP71 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM236CP0DP71 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM236CP0DP71 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM236CP0DP71 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM236CP0DP71 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM236CP0DP71 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM236CP0DP71 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM236CP0DP71 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM236CP0DP71 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM236CP0DP71 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM236CP0DP71 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM236CP0DP71 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM236CP0DP71 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM236CP0DP71 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM236CP0DP71 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM236CP0DP71 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM236CP0DP71 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM236CP0DP71 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM236CP0DP71 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM236CP0DP71 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM236CP0DP71 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM236CP0DP71 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM236CP0DP71 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM236CP0DP71 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM236CP0DP71 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM236CP0DP71 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM236CP0DP71 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM236CP0DP71 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM236CP0DP71 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM236CP0DP71 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM236CP0DP71 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM236CP0DP71 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM236CP0DP71 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM236CP0DP71 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM236CP0DP71 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM236CP0DP71 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms