Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
NEFMP07197 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
NEFMP07197 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
NEFMP07197 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
NEFMP07197 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
NEFMP07197 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
NEFMP07197 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
NEFMP07197 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
NEFMP07197 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
NEFMP07197 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
NEFMP07197 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
NEFMP07197 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
NEFMP07197 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
NEFMP07197 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
NEFMP07197 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
NEFMP07197 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
NEFMP07197 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
NEFMP07197 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
NEFMP07197 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
NEFMP07197 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
NEFMP07197 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
NEFMP07197 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
NEFMP07197 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
NEFMP07197 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.68
NEFMP07197 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
NEFMP07197 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
NEFMP07197 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
NEFMP07197 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
NEFMP07197 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
NEFMP07197 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
NEFMP07197 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
NEFMP07197 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
NEFMP07197 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
NEFMP07197 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
NEFMP07197 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
NEFMP07197 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
NEFMP07197 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
NEFMP07197 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NEFMP07197 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NEFMP07197 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
NEFMP07197 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NEFMP07197 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
NEFMP07197 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NEFMP07197 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
NEFMP07197 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
NEFMP07197 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
NEFMP07197 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
NEFMP07197 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
NEFMP07197 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC37.63■■■■□ 3.61
NEFMP07197 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NEFMP07197 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NEFMP07197 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
NEFMP07197 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
NEFMP07197 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
NEFMP07197 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
NEFMP07197 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
NEFMP07197 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NEFMP07197 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NEFMP07197 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
NEFMP07197 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
NEFMP07197 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NEFMP07197 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
NEFMP07197 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
NEFMP07197 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
NEFMP07197 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
NEFMP07197 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
NEFMP07197 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
NEFMP07197 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
NEFMP07197 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
NEFMP07197 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
NEFMP07197 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
NEFMP07197 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
NEFMP07197 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
NEFMP07197 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
NEFMP07197 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
NEFMP07197 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
NEFMP07197 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
NEFMP07197 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
NEFMP07197 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
NEFMP07197 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
NEFMP07197 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
NEFMP07197 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
NEFMP07197 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
NEFMP07197 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NEFMP07197 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
NEFMP07197 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
NEFMP07197 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
NEFMP07197 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
NEFMP07197 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
NEFMP07197 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
NEFMP07197 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NEFMP07197 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC36.99■■■■□ 3.51
NEFMP07197 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NEFMP07197 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC36.97■■■■□ 3.51
NEFMP07197 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NEFMP07197 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NEFMP07197 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NEFMP07197 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NEFMP07197 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.5
NEFMP07197 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms