Protein–RNA interactions for Protein: P05386

RPLP1, 60S acidic ribosomal protein P1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPLP1P05386 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPLP1P05386 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RPLP1P05386 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPLP1P05386 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPLP1P05386 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPLP1P05386 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPLP1P05386 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPLP1P05386 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPLP1P05386 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPLP1P05386 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPLP1P05386 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPLP1P05386 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPLP1P05386 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPLP1P05386 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPLP1P05386 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPLP1P05386 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPLP1P05386 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPLP1P05386 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPLP1P05386 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPLP1P05386 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPLP1P05386 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPLP1P05386 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RPLP1P05386 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPLP1P05386 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPLP1P05386 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPLP1P05386 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPLP1P05386 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPLP1P05386 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPLP1P05386 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPLP1P05386 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPLP1P05386 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPLP1P05386 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPLP1P05386 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPLP1P05386 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPLP1P05386 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPLP1P05386 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPLP1P05386 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPLP1P05386 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPLP1P05386 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPLP1P05386 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RPLP1P05386 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPLP1P05386 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPLP1P05386 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPLP1P05386 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPLP1P05386 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPLP1P05386 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPLP1P05386 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPLP1P05386 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPLP1P05386 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPLP1P05386 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPLP1P05386 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPLP1P05386 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPLP1P05386 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPLP1P05386 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPLP1P05386 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPLP1P05386 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPLP1P05386 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPLP1P05386 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPLP1P05386 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPLP1P05386 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPLP1P05386 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPLP1P05386 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPLP1P05386 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPLP1P05386 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPLP1P05386 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPLP1P05386 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPLP1P05386 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPLP1P05386 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPLP1P05386 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPLP1P05386 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPLP1P05386 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPLP1P05386 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPLP1P05386 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPLP1P05386 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPLP1P05386 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPLP1P05386 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPLP1P05386 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPLP1P05386 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPLP1P05386 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPLP1P05386 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPLP1P05386 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPLP1P05386 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPLP1P05386 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPLP1P05386 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPLP1P05386 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPLP1P05386 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPLP1P05386 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPLP1P05386 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPLP1P05386 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPLP1P05386 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPLP1P05386 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPLP1P05386 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPLP1P05386 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPLP1P05386 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RPLP1P05386 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPLP1P05386 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPLP1P05386 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPLP1P05386 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPLP1P05386 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPLP1P05386 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms