Protein–RNA interactions for Protein: P02652

APOA2, Apolipoprotein A-II, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA2P02652 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOA2P02652 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOA2P02652 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOA2P02652 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOA2P02652 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOA2P02652 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOA2P02652 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOA2P02652 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOA2P02652 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOA2P02652 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA2P02652 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA2P02652 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOA2P02652 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOA2P02652 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOA2P02652 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOA2P02652 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOA2P02652 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOA2P02652 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOA2P02652 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA2P02652 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA2P02652 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOA2P02652 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA2P02652 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOA2P02652 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA2P02652 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOA2P02652 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOA2P02652 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOA2P02652 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOA2P02652 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOA2P02652 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOA2P02652 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOA2P02652 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOA2P02652 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOA2P02652 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOA2P02652 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA2P02652 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA2P02652 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA2P02652 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA2P02652 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOA2P02652 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOA2P02652 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOA2P02652 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOA2P02652 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
APOA2P02652 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA2P02652 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOA2P02652 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOA2P02652 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOA2P02652 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOA2P02652 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA2P02652 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOA2P02652 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOA2P02652 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA2P02652 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA2P02652 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA2P02652 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOA2P02652 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOA2P02652 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOA2P02652 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOA2P02652 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOA2P02652 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOA2P02652 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA2P02652 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOA2P02652 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOA2P02652 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOA2P02652 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOA2P02652 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA2P02652 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA2P02652 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA2P02652 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA2P02652 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA2P02652 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA2P02652 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA2P02652 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA2P02652 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA2P02652 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOA2P02652 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOA2P02652 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
APOA2P02652 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOA2P02652 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOA2P02652 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA2P02652 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA2P02652 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA2P02652 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA2P02652 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOA2P02652 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOA2P02652 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOA2P02652 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOA2P02652 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOA2P02652 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOA2P02652 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOA2P02652 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOA2P02652 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOA2P02652 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA2P02652 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA2P02652 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA2P02652 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA2P02652 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA2P02652 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOA2P02652 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOA2P02652 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms