Protein–RNA interactions for Protein: P01911

HLA-DRB1, HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-15 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRB1P01911 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DRB1P01911 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DRB1P01911 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DRB1P01911 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DRB1P01911 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DRB1P01911 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DRB1P01911 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DRB1P01911 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DRB1P01911 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DRB1P01911 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DRB1P01911 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DRB1P01911 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DRB1P01911 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DRB1P01911 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DRB1P01911 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DRB1P01911 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DRB1P01911 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DRB1P01911 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DRB1P01911 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DRB1P01911 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DRB1P01911 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DRB1P01911 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DRB1P01911 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DRB1P01911 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DRB1P01911 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DRB1P01911 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DRB1P01911 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-DRB1P01911 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-DRB1P01911 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-DRB1P01911 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HLA-DRB1P01911 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-DRB1P01911 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-DRB1P01911 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DRB1P01911 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DRB1P01911 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DRB1P01911 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DRB1P01911 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DRB1P01911 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DRB1P01911 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DRB1P01911 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-DRB1P01911 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-DRB1P01911 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-DRB1P01911 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DRB1P01911 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DRB1P01911 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DRB1P01911 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DRB1P01911 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DRB1P01911 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DRB1P01911 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DRB1P01911 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DRB1P01911 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-DRB1P01911 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DRB1P01911 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DRB1P01911 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DRB1P01911 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DRB1P01911 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DRB1P01911 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DRB1P01911 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DRB1P01911 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HLA-DRB1P01911 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DRB1P01911 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DRB1P01911 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DRB1P01911 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DRB1P01911 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DRB1P01911 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DRB1P01911 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DRB1P01911 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DRB1P01911 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DRB1P01911 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DRB1P01911 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DRB1P01911 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DRB1P01911 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DRB1P01911 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DRB1P01911 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DRB1P01911 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HLA-DRB1P01911 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DRB1P01911 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DRB1P01911 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DRB1P01911 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DRB1P01911 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DRB1P01911 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DRB1P01911 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DRB1P01911 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DRB1P01911 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-DRB1P01911 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DRB1P01911 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DRB1P01911 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DRB1P01911 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DRB1P01911 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DRB1P01911 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DRB1P01911 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DRB1P01911 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DRB1P01911 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DRB1P01911 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HLA-DRB1P01911 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DRB1P01911 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DRB1P01911 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DRB1P01911 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DRB1P01911 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DRB1P01911 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms