Protein–RNA interactions for Protein: P01766

IGHV3-13, Immunoglobulin heavy variable 3-13, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-13P01766 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHV3-13P01766 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGHV3-13P01766 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IGHV3-13P01766 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGHV3-13P01766 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGHV3-13P01766 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGHV3-13P01766 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGHV3-13P01766 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGHV3-13P01766 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGHV3-13P01766 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGHV3-13P01766 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGHV3-13P01766 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGHV3-13P01766 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGHV3-13P01766 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGHV3-13P01766 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGHV3-13P01766 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGHV3-13P01766 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGHV3-13P01766 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGHV3-13P01766 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
IGHV3-13P01766 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGHV3-13P01766 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGHV3-13P01766 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGHV3-13P01766 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGHV3-13P01766 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGHV3-13P01766 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGHV3-13P01766 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGHV3-13P01766 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGHV3-13P01766 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGHV3-13P01766 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGHV3-13P01766 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGHV3-13P01766 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGHV3-13P01766 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGHV3-13P01766 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGHV3-13P01766 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGHV3-13P01766 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGHV3-13P01766 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
IGHV3-13P01766 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGHV3-13P01766 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGHV3-13P01766 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGHV3-13P01766 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGHV3-13P01766 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGHV3-13P01766 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGHV3-13P01766 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGHV3-13P01766 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGHV3-13P01766 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGHV3-13P01766 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGHV3-13P01766 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGHV3-13P01766 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGHV3-13P01766 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGHV3-13P01766 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGHV3-13P01766 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGHV3-13P01766 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGHV3-13P01766 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGHV3-13P01766 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGHV3-13P01766 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGHV3-13P01766 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGHV3-13P01766 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGHV3-13P01766 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGHV3-13P01766 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGHV3-13P01766 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGHV3-13P01766 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGHV3-13P01766 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IGHV3-13P01766 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGHV3-13P01766 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGHV3-13P01766 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGHV3-13P01766 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGHV3-13P01766 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGHV3-13P01766 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGHV3-13P01766 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGHV3-13P01766 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGHV3-13P01766 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGHV3-13P01766 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGHV3-13P01766 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGHV3-13P01766 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGHV3-13P01766 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGHV3-13P01766 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGHV3-13P01766 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IGHV3-13P01766 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGHV3-13P01766 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGHV3-13P01766 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGHV3-13P01766 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGHV3-13P01766 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGHV3-13P01766 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGHV3-13P01766 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGHV3-13P01766 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGHV3-13P01766 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGHV3-13P01766 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGHV3-13P01766 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGHV3-13P01766 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGHV3-13P01766 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGHV3-13P01766 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGHV3-13P01766 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGHV3-13P01766 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGHV3-13P01766 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGHV3-13P01766 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGHV3-13P01766 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGHV3-13P01766 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGHV3-13P01766 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGHV3-13P01766 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGHV3-13P01766 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms