Protein–RNA interactions for Protein: P01763

IGHV3-48, Immunoglobulin heavy variable 3-48, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-48P01763 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHV3-48P01763 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHV3-48P01763 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGHV3-48P01763 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHV3-48P01763 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHV3-48P01763 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHV3-48P01763 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHV3-48P01763 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHV3-48P01763 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHV3-48P01763 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGHV3-48P01763 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGHV3-48P01763 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHV3-48P01763 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGHV3-48P01763 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHV3-48P01763 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHV3-48P01763 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHV3-48P01763 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHV3-48P01763 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHV3-48P01763 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHV3-48P01763 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGHV3-48P01763 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGHV3-48P01763 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHV3-48P01763 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHV3-48P01763 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGHV3-48P01763 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHV3-48P01763 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHV3-48P01763 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHV3-48P01763 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHV3-48P01763 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGHV3-48P01763 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGHV3-48P01763 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV3-48P01763 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHV3-48P01763 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHV3-48P01763 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-48P01763 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHV3-48P01763 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV3-48P01763 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV3-48P01763 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV3-48P01763 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHV3-48P01763 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHV3-48P01763 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHV3-48P01763 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHV3-48P01763 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGHV3-48P01763 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHV3-48P01763 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHV3-48P01763 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV3-48P01763 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHV3-48P01763 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-48P01763 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-48P01763 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-48P01763 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-48P01763 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-48P01763 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-48P01763 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-48P01763 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-48P01763 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-48P01763 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV3-48P01763 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV3-48P01763 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHV3-48P01763 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV3-48P01763 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV3-48P01763 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV3-48P01763 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHV3-48P01763 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHV3-48P01763 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-48P01763 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-48P01763 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-48P01763 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-48P01763 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-48P01763 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-48P01763 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-48P01763 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-48P01763 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-48P01763 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-48P01763 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-48P01763 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-48P01763 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IGHV3-48P01763 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGHV3-48P01763 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IGHV3-48P01763 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
IGHV3-48P01763 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHV3-48P01763 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHV3-48P01763 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHV3-48P01763 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHV3-48P01763 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHV3-48P01763 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHV3-48P01763 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGHV3-48P01763 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGHV3-48P01763 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGHV3-48P01763 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGHV3-48P01763 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGHV3-48P01763 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGHV3-48P01763 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-48P01763 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-48P01763 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-48P01763 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGHV3-48P01763 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGHV3-48P01763 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
IGHV3-48P01763 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGHV3-48P01763 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms