Protein–RNA interactions for Protein: P01737

T-cell receptor alpha chain V region PY14, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01737 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01737 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01737 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01737 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01737 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01737 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01737 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01737 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01737 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01737 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01737 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01737 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P01737 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P01737 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P01737 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P01737 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P01737 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
P01737 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01737 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01737 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01737 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01737 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01737 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
P01737 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01737 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01737 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
P01737 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01737 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01737 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01737 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01737 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01737 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01737 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01737 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01737 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
P01737 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01737 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01737 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01737 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01737 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01737 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01737 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01737 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01737 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01737 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01737 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01737 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01737 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01737 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01737 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01737 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01737 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01737 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01737 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01737 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01737 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01737 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01737 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01737 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01737 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01737 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01737 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
P01737 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01737 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01737 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01737 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01737 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01737 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01737 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01737 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01737 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01737 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
P01737 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01737 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
P01737 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01737 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01737 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01737 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01737 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01737 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01737 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01737 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01737 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01737 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01737 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01737 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01737 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
P01737 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P01737 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P01737 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01737 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01737 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01737 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01737 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01737 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01737 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01737 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01737 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01737 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01737 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms