Protein–RNA interactions for Protein: P01602

IGKV1-5, Immunoglobulin kappa variable 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-5P01602 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGKV1-5P01602 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGKV1-5P01602 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGKV1-5P01602 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IGKV1-5P01602 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGKV1-5P01602 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGKV1-5P01602 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGKV1-5P01602 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGKV1-5P01602 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGKV1-5P01602 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGKV1-5P01602 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGKV1-5P01602 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGKV1-5P01602 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGKV1-5P01602 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGKV1-5P01602 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGKV1-5P01602 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGKV1-5P01602 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGKV1-5P01602 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGKV1-5P01602 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGKV1-5P01602 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGKV1-5P01602 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGKV1-5P01602 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGKV1-5P01602 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGKV1-5P01602 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGKV1-5P01602 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGKV1-5P01602 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGKV1-5P01602 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGKV1-5P01602 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGKV1-5P01602 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGKV1-5P01602 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGKV1-5P01602 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGKV1-5P01602 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGKV1-5P01602 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGKV1-5P01602 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGKV1-5P01602 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGKV1-5P01602 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGKV1-5P01602 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGKV1-5P01602 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGKV1-5P01602 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGKV1-5P01602 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGKV1-5P01602 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGKV1-5P01602 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGKV1-5P01602 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGKV1-5P01602 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGKV1-5P01602 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IGKV1-5P01602 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGKV1-5P01602 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGKV1-5P01602 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGKV1-5P01602 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGKV1-5P01602 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGKV1-5P01602 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGKV1-5P01602 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGKV1-5P01602 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
IGKV1-5P01602 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGKV1-5P01602 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGKV1-5P01602 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGKV1-5P01602 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGKV1-5P01602 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGKV1-5P01602 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGKV1-5P01602 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGKV1-5P01602 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGKV1-5P01602 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGKV1-5P01602 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGKV1-5P01602 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGKV1-5P01602 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGKV1-5P01602 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGKV1-5P01602 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGKV1-5P01602 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGKV1-5P01602 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGKV1-5P01602 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGKV1-5P01602 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGKV1-5P01602 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGKV1-5P01602 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGKV1-5P01602 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGKV1-5P01602 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGKV1-5P01602 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGKV1-5P01602 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGKV1-5P01602 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGKV1-5P01602 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGKV1-5P01602 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGKV1-5P01602 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGKV1-5P01602 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGKV1-5P01602 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGKV1-5P01602 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGKV1-5P01602 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGKV1-5P01602 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGKV1-5P01602 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGKV1-5P01602 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGKV1-5P01602 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGKV1-5P01602 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGKV1-5P01602 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGKV1-5P01602 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGKV1-5P01602 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGKV1-5P01602 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGKV1-5P01602 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGKV1-5P01602 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGKV1-5P01602 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGKV1-5P01602 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGKV1-5P01602 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGKV1-5P01602 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms