Protein–RNA interactions for Protein: P01130

LDLR, Low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRP01130 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LDLRP01130 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LDLRP01130 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LDLRP01130 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LDLRP01130 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LDLRP01130 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LDLRP01130 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LDLRP01130 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LDLRP01130 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LDLRP01130 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LDLRP01130 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LDLRP01130 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LDLRP01130 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LDLRP01130 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LDLRP01130 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LDLRP01130 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LDLRP01130 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LDLRP01130 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LDLRP01130 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LDLRP01130 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
LDLRP01130 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LDLRP01130 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LDLRP01130 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LDLRP01130 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LDLRP01130 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LDLRP01130 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LDLRP01130 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LDLRP01130 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LDLRP01130 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LDLRP01130 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LDLRP01130 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LDLRP01130 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LDLRP01130 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LDLRP01130 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LDLRP01130 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LDLRP01130 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LDLRP01130 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LDLRP01130 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LDLRP01130 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LDLRP01130 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LDLRP01130 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LDLRP01130 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LDLRP01130 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LDLRP01130 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LDLRP01130 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LDLRP01130 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LDLRP01130 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LDLRP01130 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LDLRP01130 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LDLRP01130 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LDLRP01130 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LDLRP01130 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LDLRP01130 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LDLRP01130 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LDLRP01130 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LDLRP01130 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LDLRP01130 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LDLRP01130 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LDLRP01130 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LDLRP01130 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LDLRP01130 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LDLRP01130 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LDLRP01130 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LDLRP01130 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LDLRP01130 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LDLRP01130 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LDLRP01130 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LDLRP01130 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LDLRP01130 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LDLRP01130 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LDLRP01130 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LDLRP01130 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LDLRP01130 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LDLRP01130 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LDLRP01130 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LDLRP01130 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LDLRP01130 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LDLRP01130 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LDLRP01130 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LDLRP01130 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LDLRP01130 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LDLRP01130 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LDLRP01130 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LDLRP01130 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LDLRP01130 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LDLRP01130 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LDLRP01130 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LDLRP01130 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LDLRP01130 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LDLRP01130 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LDLRP01130 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LDLRP01130 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LDLRP01130 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LDLRP01130 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LDLRP01130 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LDLRP01130 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LDLRP01130 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LDLRP01130 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LDLRP01130 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LDLRP01130 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms