Protein–RNA interactions for Protein: P00395

MT-CO1, Cytochrome c oxidase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-CO1P00395 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MT-CO1P00395 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MT-CO1P00395 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MT-CO1P00395 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
MT-CO1P00395 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MT-CO1P00395 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MT-CO1P00395 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MT-CO1P00395 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MT-CO1P00395 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MT-CO1P00395 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MT-CO1P00395 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MT-CO1P00395 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MT-CO1P00395 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MT-CO1P00395 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MT-CO1P00395 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MT-CO1P00395 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MT-CO1P00395 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
MT-CO1P00395 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MT-CO1P00395 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MT-CO1P00395 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MT-CO1P00395 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MT-CO1P00395 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MT-CO1P00395 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MT-CO1P00395 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MT-CO1P00395 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
MT-CO1P00395 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MT-CO1P00395 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
MT-CO1P00395 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MT-CO1P00395 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MT-CO1P00395 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MT-CO1P00395 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MT-CO1P00395 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MT-CO1P00395 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MT-CO1P00395 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MT-CO1P00395 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MT-CO1P00395 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MT-CO1P00395 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MT-CO1P00395 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MT-CO1P00395 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MT-CO1P00395 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MT-CO1P00395 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MT-CO1P00395 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MT-CO1P00395 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MT-CO1P00395 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MT-CO1P00395 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MT-CO1P00395 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MT-CO1P00395 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MT-CO1P00395 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MT-CO1P00395 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MT-CO1P00395 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MT-CO1P00395 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MT-CO1P00395 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MT-CO1P00395 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MT-CO1P00395 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
MT-CO1P00395 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MT-CO1P00395 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MT-CO1P00395 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MT-CO1P00395 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MT-CO1P00395 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MT-CO1P00395 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MT-CO1P00395 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MT-CO1P00395 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MT-CO1P00395 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MT-CO1P00395 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MT-CO1P00395 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MT-CO1P00395 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MT-CO1P00395 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MT-CO1P00395 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MT-CO1P00395 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MT-CO1P00395 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MT-CO1P00395 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MT-CO1P00395 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MT-CO1P00395 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MT-CO1P00395 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MT-CO1P00395 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MT-CO1P00395 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MT-CO1P00395 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MT-CO1P00395 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MT-CO1P00395 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MT-CO1P00395 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MT-CO1P00395 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MT-CO1P00395 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MT-CO1P00395 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MT-CO1P00395 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MT-CO1P00395 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MT-CO1P00395 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
MT-CO1P00395 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MT-CO1P00395 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MT-CO1P00395 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MT-CO1P00395 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MT-CO1P00395 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MT-CO1P00395 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MT-CO1P00395 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MT-CO1P00395 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MT-CO1P00395 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MT-CO1P00395 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MT-CO1P00395 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MT-CO1P00395 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MT-CO1P00395 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MT-CO1P00395 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms