Protein–RNA interactions for Protein: O94886

TMEM63A, CSC1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM63AO94886 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMEM63AO94886 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMEM63AO94886 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMEM63AO94886 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMEM63AO94886 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMEM63AO94886 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMEM63AO94886 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMEM63AO94886 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMEM63AO94886 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMEM63AO94886 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMEM63AO94886 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMEM63AO94886 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMEM63AO94886 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMEM63AO94886 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMEM63AO94886 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMEM63AO94886 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMEM63AO94886 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMEM63AO94886 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMEM63AO94886 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM63AO94886 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMEM63AO94886 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMEM63AO94886 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMEM63AO94886 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMEM63AO94886 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMEM63AO94886 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMEM63AO94886 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMEM63AO94886 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMEM63AO94886 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMEM63AO94886 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMEM63AO94886 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMEM63AO94886 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM63AO94886 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM63AO94886 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM63AO94886 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMEM63AO94886 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMEM63AO94886 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMEM63AO94886 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMEM63AO94886 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMEM63AO94886 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMEM63AO94886 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMEM63AO94886 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMEM63AO94886 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMEM63AO94886 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMEM63AO94886 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMEM63AO94886 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMEM63AO94886 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMEM63AO94886 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMEM63AO94886 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMEM63AO94886 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM63AO94886 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM63AO94886 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM63AO94886 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM63AO94886 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM63AO94886 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMEM63AO94886 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM63AO94886 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMEM63AO94886 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMEM63AO94886 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMEM63AO94886 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM63AO94886 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMEM63AO94886 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMEM63AO94886 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TMEM63AO94886 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TMEM63AO94886 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMEM63AO94886 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMEM63AO94886 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TMEM63AO94886 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMEM63AO94886 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMEM63AO94886 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM63AO94886 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM63AO94886 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMEM63AO94886 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMEM63AO94886 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TMEM63AO94886 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMEM63AO94886 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM63AO94886 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM63AO94886 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMEM63AO94886 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMEM63AO94886 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMEM63AO94886 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMEM63AO94886 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMEM63AO94886 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMEM63AO94886 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMEM63AO94886 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMEM63AO94886 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMEM63AO94886 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMEM63AO94886 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMEM63AO94886 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMEM63AO94886 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMEM63AO94886 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMEM63AO94886 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMEM63AO94886 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMEM63AO94886 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMEM63AO94886 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMEM63AO94886 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMEM63AO94886 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMEM63AO94886 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMEM63AO94886 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMEM63AO94886 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMEM63AO94886 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms