Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ALDH1A2O94788 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ALDH1A2O94788 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ALDH1A2O94788 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ALDH1A2O94788 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ALDH1A2O94788 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ALDH1A2O94788 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ALDH1A2O94788 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ALDH1A2O94788 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ALDH1A2O94788 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
ALDH1A2O94788 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ALDH1A2O94788 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ALDH1A2O94788 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ALDH1A2O94788 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ALDH1A2O94788 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ALDH1A2O94788 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ALDH1A2O94788 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ALDH1A2O94788 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ALDH1A2O94788 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ALDH1A2O94788 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ALDH1A2O94788 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ALDH1A2O94788 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ALDH1A2O94788 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ALDH1A2O94788 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ALDH1A2O94788 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
ALDH1A2O94788 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
ALDH1A2O94788 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
ALDH1A2O94788 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ALDH1A2O94788 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ALDH1A2O94788 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ALDH1A2O94788 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ALDH1A2O94788 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ALDH1A2O94788 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALDH1A2O94788 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ALDH1A2O94788 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ALDH1A2O94788 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ALDH1A2O94788 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ALDH1A2O94788 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ALDH1A2O94788 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ALDH1A2O94788 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ALDH1A2O94788 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ALDH1A2O94788 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ALDH1A2O94788 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ALDH1A2O94788 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ALDH1A2O94788 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ALDH1A2O94788 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ALDH1A2O94788 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ALDH1A2O94788 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ALDH1A2O94788 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ALDH1A2O94788 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ALDH1A2O94788 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ALDH1A2O94788 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ALDH1A2O94788 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ALDH1A2O94788 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ALDH1A2O94788 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ALDH1A2O94788 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ALDH1A2O94788 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ALDH1A2O94788 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ALDH1A2O94788 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ALDH1A2O94788 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ALDH1A2O94788 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ALDH1A2O94788 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALDH1A2O94788 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALDH1A2O94788 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALDH1A2O94788 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ALDH1A2O94788 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ALDH1A2O94788 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ALDH1A2O94788 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALDH1A2O94788 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALDH1A2O94788 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ALDH1A2O94788 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ALDH1A2O94788 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ALDH1A2O94788 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ALDH1A2O94788 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ALDH1A2O94788 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ALDH1A2O94788 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ALDH1A2O94788 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ALDH1A2O94788 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALDH1A2O94788 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALDH1A2O94788 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ALDH1A2O94788 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ALDH1A2O94788 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ALDH1A2O94788 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ALDH1A2O94788 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ALDH1A2O94788 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ALDH1A2O94788 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ALDH1A2O94788 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ALDH1A2O94788 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ALDH1A2O94788 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALDH1A2O94788 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALDH1A2O94788 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALDH1A2O94788 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALDH1A2O94788 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALDH1A2O94788 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ALDH1A2O94788 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ALDH1A2O94788 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALDH1A2O94788 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALDH1A2O94788 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALDH1A2O94788 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ALDH1A2O94788 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms