Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEBLO76041 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NEBLO76041 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEBLO76041 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
NEBLO76041 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEBLO76041 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NEBLO76041 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEBLO76041 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEBLO76041 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NEBLO76041 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEBLO76041 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEBLO76041 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEBLO76041 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NEBLO76041 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NEBLO76041 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEBLO76041 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEBLO76041 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEBLO76041 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEBLO76041 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEBLO76041 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEBLO76041 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEBLO76041 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEBLO76041 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NEBLO76041 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEBLO76041 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEBLO76041 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEBLO76041 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEBLO76041 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEBLO76041 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEBLO76041 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEBLO76041 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEBLO76041 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEBLO76041 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEBLO76041 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEBLO76041 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEBLO76041 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEBLO76041 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEBLO76041 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEBLO76041 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEBLO76041 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEBLO76041 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEBLO76041 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEBLO76041 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEBLO76041 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEBLO76041 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEBLO76041 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEBLO76041 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEBLO76041 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEBLO76041 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEBLO76041 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEBLO76041 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEBLO76041 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEBLO76041 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEBLO76041 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEBLO76041 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEBLO76041 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEBLO76041 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEBLO76041 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEBLO76041 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEBLO76041 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEBLO76041 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEBLO76041 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEBLO76041 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NEBLO76041 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEBLO76041 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEBLO76041 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEBLO76041 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEBLO76041 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NEBLO76041 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEBLO76041 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEBLO76041 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEBLO76041 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEBLO76041 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEBLO76041 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEBLO76041 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEBLO76041 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEBLO76041 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEBLO76041 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEBLO76041 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEBLO76041 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEBLO76041 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEBLO76041 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEBLO76041 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEBLO76041 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEBLO76041 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEBLO76041 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEBLO76041 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEBLO76041 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEBLO76041 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NEBLO76041 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEBLO76041 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEBLO76041 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEBLO76041 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEBLO76041 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEBLO76041 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEBLO76041 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEBLO76041 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEBLO76041 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEBLO76041 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEBLO76041 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms