Protein–RNA interactions for Protein: O75923

DYSF, Dysferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,080 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSFO75923 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DYSFO75923 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DYSFO75923 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DYSFO75923 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DYSFO75923 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DYSFO75923 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DYSFO75923 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DYSFO75923 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DYSFO75923 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DYSFO75923 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DYSFO75923 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DYSFO75923 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DYSFO75923 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DYSFO75923 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DYSFO75923 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DYSFO75923 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DYSFO75923 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYSFO75923 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYSFO75923 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DYSFO75923 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DYSFO75923 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DYSFO75923 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYSFO75923 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYSFO75923 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYSFO75923 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DYSFO75923 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DYSFO75923 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DYSFO75923 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DYSFO75923 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DYSFO75923 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DYSFO75923 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DYSFO75923 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DYSFO75923 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DYSFO75923 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DYSFO75923 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DYSFO75923 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DYSFO75923 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DYSFO75923 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DYSFO75923 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DYSFO75923 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DYSFO75923 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DYSFO75923 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DYSFO75923 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DYSFO75923 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DYSFO75923 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DYSFO75923 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DYSFO75923 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DYSFO75923 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DYSFO75923 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DYSFO75923 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DYSFO75923 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DYSFO75923 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DYSFO75923 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DYSFO75923 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DYSFO75923 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DYSFO75923 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DYSFO75923 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DYSFO75923 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DYSFO75923 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DYSFO75923 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DYSFO75923 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DYSFO75923 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DYSFO75923 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DYSFO75923 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DYSFO75923 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DYSFO75923 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DYSFO75923 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DYSFO75923 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DYSFO75923 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DYSFO75923 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DYSFO75923 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DYSFO75923 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DYSFO75923 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DYSFO75923 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DYSFO75923 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DYSFO75923 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DYSFO75923 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DYSFO75923 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DYSFO75923 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DYSFO75923 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DYSFO75923 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DYSFO75923 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DYSFO75923 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DYSFO75923 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DYSFO75923 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DYSFO75923 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DYSFO75923 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DYSFO75923 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DYSFO75923 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DYSFO75923 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DYSFO75923 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DYSFO75923 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DYSFO75923 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DYSFO75923 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DYSFO75923 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DYSFO75923 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DYSFO75923 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DYSFO75923 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DYSFO75923 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DYSFO75923 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms