Protein–RNA interactions for Protein: O75346

ZNF253, Zinc finger protein 253, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF253O75346 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF253O75346 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF253O75346 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF253O75346 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF253O75346 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF253O75346 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF253O75346 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF253O75346 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF253O75346 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF253O75346 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF253O75346 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF253O75346 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF253O75346 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF253O75346 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF253O75346 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF253O75346 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF253O75346 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF253O75346 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF253O75346 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF253O75346 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF253O75346 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF253O75346 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF253O75346 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF253O75346 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF253O75346 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF253O75346 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF253O75346 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF253O75346 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF253O75346 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF253O75346 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF253O75346 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF253O75346 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF253O75346 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF253O75346 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF253O75346 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF253O75346 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF253O75346 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF253O75346 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF253O75346 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF253O75346 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF253O75346 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF253O75346 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF253O75346 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF253O75346 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF253O75346 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF253O75346 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF253O75346 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF253O75346 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF253O75346 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF253O75346 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF253O75346 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF253O75346 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF253O75346 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF253O75346 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF253O75346 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF253O75346 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF253O75346 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF253O75346 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF253O75346 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF253O75346 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF253O75346 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF253O75346 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF253O75346 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF253O75346 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF253O75346 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF253O75346 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF253O75346 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF253O75346 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF253O75346 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF253O75346 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF253O75346 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF253O75346 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF253O75346 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF253O75346 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF253O75346 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF253O75346 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF253O75346 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF253O75346 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF253O75346 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF253O75346 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF253O75346 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF253O75346 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF253O75346 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF253O75346 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF253O75346 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF253O75346 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF253O75346 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF253O75346 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF253O75346 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF253O75346 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF253O75346 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF253O75346 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF253O75346 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF253O75346 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF253O75346 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZNF253O75346 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF253O75346 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF253O75346 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF253O75346 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF253O75346 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms