Protein–RNA interactions for Protein: O75298

RTN2, Reticulon-2, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN2O75298 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RTN2O75298 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RTN2O75298 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RTN2O75298 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RTN2O75298 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RTN2O75298 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RTN2O75298 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RTN2O75298 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RTN2O75298 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RTN2O75298 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RTN2O75298 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RTN2O75298 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RTN2O75298 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RTN2O75298 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RTN2O75298 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
RTN2O75298 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RTN2O75298 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RTN2O75298 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RTN2O75298 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RTN2O75298 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RTN2O75298 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RTN2O75298 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RTN2O75298 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
RTN2O75298 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RTN2O75298 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RTN2O75298 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RTN2O75298 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RTN2O75298 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RTN2O75298 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RTN2O75298 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RTN2O75298 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RTN2O75298 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RTN2O75298 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RTN2O75298 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RTN2O75298 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RTN2O75298 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RTN2O75298 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RTN2O75298 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RTN2O75298 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RTN2O75298 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RTN2O75298 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RTN2O75298 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RTN2O75298 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RTN2O75298 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RTN2O75298 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RTN2O75298 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RTN2O75298 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RTN2O75298 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
RTN2O75298 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RTN2O75298 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RTN2O75298 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RTN2O75298 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RTN2O75298 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RTN2O75298 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RTN2O75298 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RTN2O75298 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RTN2O75298 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RTN2O75298 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RTN2O75298 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RTN2O75298 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RTN2O75298 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RTN2O75298 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RTN2O75298 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RTN2O75298 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RTN2O75298 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RTN2O75298 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RTN2O75298 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RTN2O75298 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RTN2O75298 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RTN2O75298 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RTN2O75298 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RTN2O75298 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RTN2O75298 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RTN2O75298 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RTN2O75298 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RTN2O75298 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RTN2O75298 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RTN2O75298 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RTN2O75298 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RTN2O75298 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RTN2O75298 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RTN2O75298 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RTN2O75298 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RTN2O75298 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
RTN2O75298 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RTN2O75298 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RTN2O75298 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
RTN2O75298 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RTN2O75298 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RTN2O75298 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RTN2O75298 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RTN2O75298 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RTN2O75298 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RTN2O75298 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RTN2O75298 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RTN2O75298 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RTN2O75298 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RTN2O75298 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTN2O75298 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTN2O75298 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms