Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
N4BP1O75113 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
N4BP1O75113 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
N4BP1O75113 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
N4BP1O75113 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
N4BP1O75113 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
N4BP1O75113 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
N4BP1O75113 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
N4BP1O75113 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
N4BP1O75113 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
N4BP1O75113 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
N4BP1O75113 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
N4BP1O75113 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
N4BP1O75113 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
N4BP1O75113 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
N4BP1O75113 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
N4BP1O75113 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
N4BP1O75113 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
N4BP1O75113 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
N4BP1O75113 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
N4BP1O75113 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
N4BP1O75113 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
N4BP1O75113 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
N4BP1O75113 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
N4BP1O75113 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
N4BP1O75113 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
N4BP1O75113 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
N4BP1O75113 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
N4BP1O75113 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
N4BP1O75113 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
N4BP1O75113 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
N4BP1O75113 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
N4BP1O75113 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
N4BP1O75113 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
N4BP1O75113 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
N4BP1O75113 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
N4BP1O75113 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
N4BP1O75113 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
N4BP1O75113 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
N4BP1O75113 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
N4BP1O75113 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
N4BP1O75113 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
N4BP1O75113 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
N4BP1O75113 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
N4BP1O75113 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
N4BP1O75113 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
N4BP1O75113 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
N4BP1O75113 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
N4BP1O75113 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
N4BP1O75113 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
N4BP1O75113 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
N4BP1O75113 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
N4BP1O75113 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
N4BP1O75113 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
N4BP1O75113 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
N4BP1O75113 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
N4BP1O75113 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
N4BP1O75113 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
N4BP1O75113 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
N4BP1O75113 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
N4BP1O75113 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
N4BP1O75113 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
N4BP1O75113 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
N4BP1O75113 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
N4BP1O75113 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
N4BP1O75113 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
N4BP1O75113 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
N4BP1O75113 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
N4BP1O75113 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
N4BP1O75113 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
N4BP1O75113 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
N4BP1O75113 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
N4BP1O75113 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
N4BP1O75113 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
N4BP1O75113 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
N4BP1O75113 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
N4BP1O75113 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
N4BP1O75113 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
N4BP1O75113 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
N4BP1O75113 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
N4BP1O75113 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
N4BP1O75113 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
N4BP1O75113 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
N4BP1O75113 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
N4BP1O75113 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
N4BP1O75113 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
N4BP1O75113 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
N4BP1O75113 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
N4BP1O75113 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
N4BP1O75113 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
N4BP1O75113 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
N4BP1O75113 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
N4BP1O75113 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
N4BP1O75113 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
N4BP1O75113 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
N4BP1O75113 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
N4BP1O75113 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
N4BP1O75113 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
N4BP1O75113 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
N4BP1O75113 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms