Protein–RNA interactions for Protein: O75044

SRGAP2, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,071 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2O75044 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SRGAP2O75044 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SRGAP2O75044 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SRGAP2O75044 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SRGAP2O75044 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SRGAP2O75044 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SRGAP2O75044 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SRGAP2O75044 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SRGAP2O75044 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SRGAP2O75044 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SRGAP2O75044 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SRGAP2O75044 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SRGAP2O75044 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
SRGAP2O75044 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
SRGAP2O75044 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
SRGAP2O75044 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SRGAP2O75044 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SRGAP2O75044 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SRGAP2O75044 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SRGAP2O75044 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SRGAP2O75044 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SRGAP2O75044 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SRGAP2O75044 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
SRGAP2O75044 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SRGAP2O75044 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SRGAP2O75044 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SRGAP2O75044 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SRGAP2O75044 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SRGAP2O75044 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SRGAP2O75044 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SRGAP2O75044 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
SRGAP2O75044 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SRGAP2O75044 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SRGAP2O75044 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SRGAP2O75044 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SRGAP2O75044 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SRGAP2O75044 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SRGAP2O75044 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SRGAP2O75044 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SRGAP2O75044 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SRGAP2O75044 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SRGAP2O75044 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SRGAP2O75044 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SRGAP2O75044 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SRGAP2O75044 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SRGAP2O75044 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SRGAP2O75044 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SRGAP2O75044 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SRGAP2O75044 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SRGAP2O75044 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SRGAP2O75044 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SRGAP2O75044 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SRGAP2O75044 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SRGAP2O75044 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SRGAP2O75044 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SRGAP2O75044 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SRGAP2O75044 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SRGAP2O75044 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SRGAP2O75044 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SRGAP2O75044 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SRGAP2O75044 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SRGAP2O75044 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SRGAP2O75044 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SRGAP2O75044 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SRGAP2O75044 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SRGAP2O75044 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SRGAP2O75044 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SRGAP2O75044 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SRGAP2O75044 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SRGAP2O75044 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SRGAP2O75044 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SRGAP2O75044 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SRGAP2O75044 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SRGAP2O75044 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SRGAP2O75044 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SRGAP2O75044 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SRGAP2O75044 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SRGAP2O75044 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SRGAP2O75044 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SRGAP2O75044 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SRGAP2O75044 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SRGAP2O75044 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SRGAP2O75044 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SRGAP2O75044 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SRGAP2O75044 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SRGAP2O75044 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SRGAP2O75044 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SRGAP2O75044 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SRGAP2O75044 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SRGAP2O75044 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SRGAP2O75044 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SRGAP2O75044 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SRGAP2O75044 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SRGAP2O75044 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SRGAP2O75044 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SRGAP2O75044 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SRGAP2O75044 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SRGAP2O75044 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SRGAP2O75044 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SRGAP2O75044 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms