Protein–RNA interactions for Protein: O60359

CACNG3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG3O60359 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CACNG3O60359 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CACNG3O60359 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CACNG3O60359 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CACNG3O60359 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CACNG3O60359 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CACNG3O60359 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CACNG3O60359 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CACNG3O60359 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CACNG3O60359 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CACNG3O60359 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CACNG3O60359 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CACNG3O60359 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CACNG3O60359 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CACNG3O60359 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CACNG3O60359 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CACNG3O60359 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CACNG3O60359 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CACNG3O60359 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CACNG3O60359 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CACNG3O60359 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CACNG3O60359 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CACNG3O60359 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CACNG3O60359 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CACNG3O60359 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CACNG3O60359 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CACNG3O60359 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CACNG3O60359 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CACNG3O60359 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CACNG3O60359 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CACNG3O60359 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CACNG3O60359 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CACNG3O60359 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CACNG3O60359 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CACNG3O60359 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CACNG3O60359 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CACNG3O60359 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CACNG3O60359 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CACNG3O60359 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CACNG3O60359 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CACNG3O60359 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CACNG3O60359 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CACNG3O60359 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CACNG3O60359 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CACNG3O60359 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CACNG3O60359 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CACNG3O60359 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CACNG3O60359 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CACNG3O60359 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CACNG3O60359 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CACNG3O60359 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CACNG3O60359 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CACNG3O60359 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CACNG3O60359 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CACNG3O60359 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CACNG3O60359 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CACNG3O60359 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CACNG3O60359 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CACNG3O60359 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CACNG3O60359 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CACNG3O60359 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CACNG3O60359 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CACNG3O60359 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CACNG3O60359 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CACNG3O60359 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CACNG3O60359 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CACNG3O60359 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CACNG3O60359 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CACNG3O60359 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CACNG3O60359 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CACNG3O60359 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CACNG3O60359 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CACNG3O60359 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CACNG3O60359 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CACNG3O60359 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CACNG3O60359 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CACNG3O60359 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CACNG3O60359 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CACNG3O60359 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CACNG3O60359 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CACNG3O60359 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CACNG3O60359 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CACNG3O60359 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CACNG3O60359 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CACNG3O60359 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CACNG3O60359 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CACNG3O60359 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CACNG3O60359 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CACNG3O60359 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CACNG3O60359 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CACNG3O60359 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CACNG3O60359 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CACNG3O60359 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CACNG3O60359 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CACNG3O60359 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CACNG3O60359 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CACNG3O60359 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CACNG3O60359 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CACNG3O60359 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CACNG3O60359 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms