Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC37.38■■■■□ 3.57
PLIN1O60240 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
PLIN1O60240 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PLIN1O60240 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PLIN1O60240 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PLIN1O60240 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
PLIN1O60240 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PLIN1O60240 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PLIN1O60240 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PLIN1O60240 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PLIN1O60240 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PLIN1O60240 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PLIN1O60240 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PLIN1O60240 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PLIN1O60240 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PLIN1O60240 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
PLIN1O60240 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PLIN1O60240 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PLIN1O60240 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PLIN1O60240 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PLIN1O60240 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PLIN1O60240 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PLIN1O60240 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PLIN1O60240 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.5
PLIN1O60240 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PLIN1O60240 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PLIN1O60240 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PLIN1O60240 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PLIN1O60240 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PLIN1O60240 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PLIN1O60240 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PLIN1O60240 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PLIN1O60240 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PLIN1O60240 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PLIN1O60240 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PLIN1O60240 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PLIN1O60240 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PLIN1O60240 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PLIN1O60240 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PLIN1O60240 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PLIN1O60240 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PLIN1O60240 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PLIN1O60240 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PLIN1O60240 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PLIN1O60240 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PLIN1O60240 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PLIN1O60240 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PLIN1O60240 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
PLIN1O60240 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PLIN1O60240 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PLIN1O60240 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PLIN1O60240 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PLIN1O60240 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PLIN1O60240 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PLIN1O60240 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PLIN1O60240 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PLIN1O60240 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PLIN1O60240 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PLIN1O60240 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PLIN1O60240 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PLIN1O60240 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PLIN1O60240 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PLIN1O60240 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PLIN1O60240 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PLIN1O60240 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PLIN1O60240 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PLIN1O60240 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PLIN1O60240 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.42
PLIN1O60240 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PLIN1O60240 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PLIN1O60240 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PLIN1O60240 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PLIN1O60240 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PLIN1O60240 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PLIN1O60240 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PLIN1O60240 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PLIN1O60240 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PLIN1O60240 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PLIN1O60240 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PLIN1O60240 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PLIN1O60240 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PLIN1O60240 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PLIN1O60240 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
PLIN1O60240 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PLIN1O60240 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PLIN1O60240 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PLIN1O60240 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PLIN1O60240 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PLIN1O60240 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PLIN1O60240 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PLIN1O60240 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PLIN1O60240 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PLIN1O60240 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PLIN1O60240 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PLIN1O60240 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
PLIN1O60240 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.38
PLIN1O60240 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PLIN1O60240 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PLIN1O60240 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PLIN1O60240 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms