Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
KCNQ2O43526 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
KCNQ2O43526 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
KCNQ2O43526 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC38.87■■■■□ 3.81
KCNQ2O43526 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
KCNQ2O43526 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
KCNQ2O43526 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
KCNQ2O43526 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
KCNQ2O43526 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
KCNQ2O43526 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
KCNQ2O43526 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
KCNQ2O43526 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
KCNQ2O43526 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
KCNQ2O43526 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
KCNQ2O43526 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
KCNQ2O43526 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
KCNQ2O43526 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
KCNQ2O43526 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
KCNQ2O43526 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
KCNQ2O43526 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
KCNQ2O43526 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
KCNQ2O43526 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
KCNQ2O43526 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
KCNQ2O43526 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
KCNQ2O43526 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
KCNQ2O43526 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
KCNQ2O43526 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC38.27■■■■□ 3.72
KCNQ2O43526 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
KCNQ2O43526 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
KCNQ2O43526 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
KCNQ2O43526 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
KCNQ2O43526 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
KCNQ2O43526 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
KCNQ2O43526 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
KCNQ2O43526 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
KCNQ2O43526 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
KCNQ2O43526 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
KCNQ2O43526 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
KCNQ2O43526 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
KCNQ2O43526 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
KCNQ2O43526 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
KCNQ2O43526 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
KCNQ2O43526 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
KCNQ2O43526 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
KCNQ2O43526 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
KCNQ2O43526 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
KCNQ2O43526 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
KCNQ2O43526 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
KCNQ2O43526 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
KCNQ2O43526 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
KCNQ2O43526 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
KCNQ2O43526 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
KCNQ2O43526 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
KCNQ2O43526 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
KCNQ2O43526 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
KCNQ2O43526 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
KCNQ2O43526 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
KCNQ2O43526 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
KCNQ2O43526 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC37.8■■■■□ 3.64
KCNQ2O43526 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
KCNQ2O43526 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
KCNQ2O43526 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
KCNQ2O43526 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
KCNQ2O43526 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
KCNQ2O43526 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
KCNQ2O43526 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
KCNQ2O43526 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
KCNQ2O43526 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
KCNQ2O43526 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
KCNQ2O43526 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
KCNQ2O43526 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
KCNQ2O43526 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
KCNQ2O43526 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
KCNQ2O43526 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
KCNQ2O43526 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
KCNQ2O43526 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
KCNQ2O43526 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
KCNQ2O43526 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
KCNQ2O43526 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
KCNQ2O43526 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
KCNQ2O43526 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
KCNQ2O43526 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
KCNQ2O43526 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
KCNQ2O43526 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
KCNQ2O43526 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
KCNQ2O43526 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC37.33■■■■□ 3.57
KCNQ2O43526 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
KCNQ2O43526 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
KCNQ2O43526 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
KCNQ2O43526 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
KCNQ2O43526 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
KCNQ2O43526 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
KCNQ2O43526 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
KCNQ2O43526 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
KCNQ2O43526 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
KCNQ2O43526 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
KCNQ2O43526 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
KCNQ2O43526 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
KCNQ2O43526 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
KCNQ2O43526 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms