Protein–RNA interactions for Protein: O43424

GRID2, Glutamate receptor ionotropic, delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID2O43424 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRID2O43424 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRID2O43424 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRID2O43424 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRID2O43424 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRID2O43424 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GRID2O43424 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GRID2O43424 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRID2O43424 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
GRID2O43424 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRID2O43424 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GRID2O43424 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRID2O43424 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRID2O43424 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRID2O43424 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRID2O43424 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRID2O43424 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRID2O43424 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRID2O43424 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRID2O43424 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRID2O43424 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRID2O43424 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRID2O43424 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRID2O43424 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRID2O43424 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRID2O43424 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRID2O43424 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRID2O43424 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
GRID2O43424 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRID2O43424 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRID2O43424 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
GRID2O43424 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRID2O43424 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRID2O43424 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRID2O43424 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRID2O43424 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRID2O43424 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRID2O43424 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRID2O43424 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRID2O43424 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRID2O43424 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRID2O43424 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRID2O43424 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRID2O43424 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRID2O43424 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRID2O43424 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRID2O43424 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRID2O43424 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GRID2O43424 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GRID2O43424 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRID2O43424 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRID2O43424 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRID2O43424 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRID2O43424 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRID2O43424 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRID2O43424 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRID2O43424 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
GRID2O43424 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRID2O43424 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRID2O43424 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GRID2O43424 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GRID2O43424 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRID2O43424 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRID2O43424 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRID2O43424 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRID2O43424 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRID2O43424 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRID2O43424 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRID2O43424 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRID2O43424 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRID2O43424 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRID2O43424 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRID2O43424 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRID2O43424 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRID2O43424 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRID2O43424 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GRID2O43424 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRID2O43424 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRID2O43424 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRID2O43424 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRID2O43424 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRID2O43424 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GRID2O43424 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRID2O43424 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRID2O43424 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRID2O43424 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRID2O43424 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRID2O43424 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRID2O43424 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRID2O43424 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRID2O43424 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRID2O43424 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRID2O43424 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRID2O43424 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRID2O43424 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GRID2O43424 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRID2O43424 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRID2O43424 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRID2O43424 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRID2O43424 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms