Protein–RNA interactions for Protein: O43307

ARHGEF9, Rho guanine nucleotide exchange factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF9O43307 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGEF9O43307 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGEF9O43307 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGEF9O43307 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGEF9O43307 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ARHGEF9O43307 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGEF9O43307 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGEF9O43307 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGEF9O43307 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARHGEF9O43307 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARHGEF9O43307 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARHGEF9O43307 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARHGEF9O43307 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARHGEF9O43307 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF9O43307 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF9O43307 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGEF9O43307 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGEF9O43307 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF9O43307 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGEF9O43307 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGEF9O43307 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARHGEF9O43307 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGEF9O43307 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGEF9O43307 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF9O43307 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF9O43307 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARHGEF9O43307 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARHGEF9O43307 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARHGEF9O43307 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARHGEF9O43307 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARHGEF9O43307 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARHGEF9O43307 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARHGEF9O43307 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARHGEF9O43307 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARHGEF9O43307 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGEF9O43307 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGEF9O43307 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGEF9O43307 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGEF9O43307 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARHGEF9O43307 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARHGEF9O43307 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARHGEF9O43307 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGEF9O43307 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGEF9O43307 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARHGEF9O43307 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARHGEF9O43307 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARHGEF9O43307 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARHGEF9O43307 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARHGEF9O43307 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARHGEF9O43307 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGEF9O43307 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF9O43307 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF9O43307 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGEF9O43307 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARHGEF9O43307 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGEF9O43307 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGEF9O43307 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARHGEF9O43307 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGEF9O43307 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGEF9O43307 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGEF9O43307 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGEF9O43307 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ARHGEF9O43307 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF9O43307 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF9O43307 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF9O43307 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARHGEF9O43307 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARHGEF9O43307 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARHGEF9O43307 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARHGEF9O43307 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARHGEF9O43307 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARHGEF9O43307 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARHGEF9O43307 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARHGEF9O43307 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGEF9O43307 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGEF9O43307 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF9O43307 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF9O43307 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGEF9O43307 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGEF9O43307 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGEF9O43307 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF9O43307 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF9O43307 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF9O43307 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGEF9O43307 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGEF9O43307 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGEF9O43307 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF9O43307 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF9O43307 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF9O43307 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF9O43307 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF9O43307 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF9O43307 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF9O43307 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF9O43307 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF9O43307 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGEF9O43307 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGEF9O43307 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGEF9O43307 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGEF9O43307 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms