Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 WDR18-209ENST00000591985 1498 ntTSL 514.94□□□□□ -0.025e-7■■■■■ 153.5
RBFOX2O43251 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.085e-7■■■■■ 153.5
RBFOX2O43251 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.225e-7■■■■■ 153.5
RBFOX2O43251 WDR18-211ENST00000607440 1397 ntTSL 513.15□□□□□ -0.35e-7■■■■■ 153.5
RBFOX2O43251 WDR18-201ENST00000251289 1501 ntTSL 512.11□□□□□ -0.475e-7■■■■■ 153.5
RBFOX2O43251 SYN3-202ENST00000358763 3126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.853e-7■■■■■ 151.8
RBFOX2O43251 SYN3-207ENST00000462268 488 ntTSL 36.8□□□□□ -1.323e-7■■■■■ 151.8
RBFOX2O43251 FBRSL1-204ENST00000539264 409 ntTSL 218.57■□□□□ 0.561e-14■■■■■ 150.8
RBFOX2O43251 FBRSL1-207ENST00000543360 238 ntTSL 218.52■□□□□ 0.561e-14■■■■■ 150.8
RBFOX2O43251 PTTG1IP-205ENST00000474737 580 ntTSL 311.62□□□□□ -0.552e-8■■■■■ 150.2
RBFOX2O43251 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.346e-8■■■■■ 147.5
RBFOX2O43251 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.786e-8■■■■■ 147.5
RBFOX2O43251 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.333e-8■■■■■ 146.1
RBFOX2O43251 PTTG1IP-207ENST00000494690 612 ntTSL 59.64□□□□□ -0.872e-8■■■■■ 142.4
RBFOX2O43251 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.032e-8■■■■■ 138.6
RBFOX2O43251 PTTG1IP-206ENST00000480234 398 ntTSL 315.17■□□□□ 0.022e-8■■■■■ 138.6
RBFOX2O43251 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.012e-8■■■■■ 138.6
RBFOX2O43251 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.012e-8■■■■■ 138.6
RBFOX2O43251 WDR97-206ENST00000534167 7119 ntTSL 1 (best)14.06□□□□□ -0.164e-30■■■■■ 137.6
RBFOX2O43251 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.334e-30■■■■■ 137.6
RBFOX2O43251 WDR97-203ENST00000528691 4491 ntTSL 211.24□□□□□ -0.614e-30■■■■■ 137.6
RBFOX2O43251 WDR97-204ENST00000529209 3079 ntTSL 1 (best)11.05□□□□□ -0.644e-30■■■■■ 137.6
RBFOX2O43251 WDR97-202ENST00000525150 4311 ntTSL 210.87□□□□□ -0.674e-30■■■■■ 137.6
RBFOX2O43251 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.396e-18■■■■■ 137.3
RBFOX2O43251 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.266e-18■■■■■ 137.3
RBFOX2O43251 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.196e-18■■■■■ 137.3
RBFOX2O43251 LRCH4-204ENST00000476881 1675 ntTSL 216.19■□□□□ 0.186e-18■■■■■ 137.3
RBFOX2O43251 LRCH4-202ENST00000467201 4754 ntTSL 213.34□□□□□ -0.276e-18■■■■■ 137.3
RBFOX2O43251 LRCH4-205ENST00000485554 774 ntTSL 313.25□□□□□ -0.296e-18■■■■■ 137.3
RBFOX2O43251 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.041e-7■■■■■ 136.6
RBFOX2O43251 UNKL-210ENST00000508903 3430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.791e-7■■■■■ 136.6
RBFOX2O43251 DIP2C-203ENST00000421992 757 ntTSL 510.12□□□□□ -0.798e-7■■■■■ 130.4
RBFOX2O43251 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.242e-13■■■■■ 129.7
RBFOX2O43251 RAP1GAP-202ENST00000317967 600 ntTSL 211.41□□□□□ -0.583e-7■■■■■ 128.5
RBFOX2O43251 RAP1GAP-208ENST00000464457 409 ntTSL 36.25□□□□□ -1.413e-7■■■■■ 128.5
RBFOX2O43251 RAP1GAP-210ENST00000482984 331 ntTSL 55.39□□□□□ -1.553e-7■■■■■ 128.5
RBFOX2O43251 MYO9B-209ENST00000597073 2087 ntTSL 516.41■□□□□ 0.224e-13■■■■■ 126.4
RBFOX2O43251 MYO9B-208ENST00000596942 584 ntTSL 513.85□□□□□ -0.194e-13■■■■■ 126.4
RBFOX2O43251 MYO9B-213ENST00000598419 544 ntTSL 513.34□□□□□ -0.274e-13■■■■■ 126.4
RBFOX2O43251 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.174e-8■■■■■ 124.9
RBFOX2O43251 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.094e-8■■■■■ 124.9
RBFOX2O43251 PPFIA1-222ENST00000532504 5159 ntTSL 1 (best)12.88□□□□□ -0.354e-8■■■■■ 124.9
RBFOX2O43251 PPFIA1-225ENST00000638133 814 ntTSL 311.49□□□□□ -0.574e-8■■■■■ 124.9
RBFOX2O43251 PPFIA1-219ENST00000531657 3036 ntTSL 27.73□□□□□ -1.174e-8■■■■■ 124.9
RBFOX2O43251 PPFIA1-206ENST00000526262 4537 ntTSL 1 (best)7.33□□□□□ -1.244e-8■■■■■ 124.9
RBFOX2O43251 PPFIA1-215ENST00000530548 3774 ntTSL 26.3□□□□□ -1.44e-8■■■■■ 124.9
RBFOX2O43251 PPFIA1-204ENST00000525922 358 ntTSL 35.96□□□□□ -1.464e-8■■■■■ 124.9
RBFOX2O43251 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.177e-27■■■■■ 121.5
RBFOX2O43251 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.177e-27■■■■■ 121.5
RBFOX2O43251 ZFAND2A-202ENST00000397083 852 ntTSL 1 (best)14.02□□□□□ -0.177e-27■■■■■ 121.5
RBFOX2O43251 ZFAND2A-204ENST00000471448 542 ntTSL 26.98□□□□□ -1.297e-27■■■■■ 121.5
RBFOX2O43251 ZFAND2A-207ENST00000574135 433 ntTSL 34.69□□□□□ -1.667e-27■■■■■ 121.5
RBFOX2O43251 DIP2C-202ENST00000381496 7749 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.951e-6■■■■■ 120.5
RBFOX2O43251 NKD1-202ENST00000564336 477 ntTSL 317.16■□□□□ 0.342e-8■■■■■ 118.9
RBFOX2O43251 HPCAL1-205ENST00000423674 586 ntTSL 417.53■□□□□ 0.47e-8■■■■■ 117.8
RBFOX2O43251 EIPR1-207ENST00000444776 594 ntTSL 412.38□□□□□ -0.433e-7■■■■■ 113.1
RBFOX2O43251 NKD1-201ENST00000268459 17105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.132e-8■■■■■ 112.7
RBFOX2O43251 MYO9B-207ENST00000595641 6215 ntTSL 511.33□□□□□ -0.64e-13■■■■■ 109.2
RBFOX2O43251 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.614e-13■■■■■ 109.2
RBFOX2O43251 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.654e-13■■■■■ 109.2
RBFOX2O43251 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.684e-13■■■■■ 109.2
RBFOX2O43251 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.413e-7■■■■■ 106.7
RBFOX2O43251 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.693e-7■■■■■ 106.7
RBFOX2O43251 NIPA1-203ENST00000557930 582 ntTSL 210.7□□□□□ -0.73e-7■■■■■ 106.7
RBFOX2O43251 NIPA1-205ENST00000560069 575 ntTSL 49.38□□□□□ -0.913e-7■■■■■ 106.7
RBFOX2O43251 NIPA1-204ENST00000559448 2799 ntTSL 28.85□□□□□ -0.993e-7■■■■■ 106.7
RBFOX2O43251 NIPA1-202ENST00000437912 7613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.243e-7■■■■■ 106.7
RBFOX2O43251 TRIP10-211ENST00000600491 1493 ntTSL 218.94■□□□□ 0.626e-25■■■■■ 106.4
RBFOX2O43251 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.741e-6■■■■■ 105.9
RBFOX2O43251 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.022e-18■■■■■ 105.3
RBFOX2O43251 FN3KRP-203ENST00000571594 625 ntTSL 39.84□□□□□ -0.832e-18■■■■■ 105.3
RBFOX2O43251 NDEL1-204ENST00000578172 3927 nt11.29□□□□□ -0.61e-45■■■■■ 105
RBFOX2O43251 NKTR-204ENST00000445842 560 ntTSL 518.52■□□□□ 0.568e-13■■■■■ 103.6
RBFOX2O43251 RAP1GAP-213ENST00000611549 4294 ntTSL 511.19□□□□□ -0.622e-7■■■■■ 103.6
RBFOX2O43251 RAP1GAP-201ENST00000290101 3584 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.772e-7■■■■■ 103.6
RBFOX2O43251 RAP1GAP-206ENST00000374765 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.872e-7■■■■■ 103.6
RBFOX2O43251 RAP1GAP-212ENST00000542643 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.012e-7■■■■■ 103.6
RBFOX2O43251 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.149e-9■■■■■ 103.5
RBFOX2O43251 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.049e-9■■■■■ 103.5
RBFOX2O43251 DBN1-206ENST00000472831 2667 ntTSL 213.59□□□□□ -0.239e-9■■■■■ 103.5
RBFOX2O43251 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.319e-9■■■■■ 103.5
RBFOX2O43251 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.489e-9■■■■■ 103.5
RBFOX2O43251 DBN1-204ENST00000467054 793 ntTSL 211.38□□□□□ -0.599e-9■■■■■ 103.5
RBFOX2O43251 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.354e-7■■■■■ 103.3
RBFOX2O43251 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.274e-7■■■■■ 103.3
RBFOX2O43251 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.374e-7■■■■■ 103.3
RBFOX2O43251 HPCAL1-203ENST00000419810 4781 ntTSL 1 (best)11.28□□□□□ -0.64e-7■■■■■ 103.3
RBFOX2O43251 RPS19-207ENST00000600467 420 ntTSL 216.55■□□□□ 0.242e-36■■■■■ 102.2
RBFOX2O43251 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.292e-36■■■■■ 102.2
RBFOX2O43251 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.382e-36■■■■■ 102.2
RBFOX2O43251 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.382e-36■■■■■ 102.2
RBFOX2O43251 RPS19-204ENST00000598399 1172 ntTSL 59.83□□□□□ -0.842e-36■■■■■ 102.2
RBFOX2O43251 RPS19-203ENST00000598261 307 ntTSL 39.16□□□□□ -0.942e-36■■■■■ 102.2
RBFOX2O43251 RPS19-208ENST00000601492 342 ntTSL 55.96□□□□□ -1.462e-36■■■■■ 102.2
RBFOX2O43251 CACNA2D4-215ENST00000542340 558 ntTSL 315.61■□□□□ 0.092e-7■■■■■ 102.1
RBFOX2O43251 CACNA2D4-211ENST00000540728 596 ntTSL 213.2□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 102.1
RBFOX2O43251 CACNA2D4-212ENST00000541331 498 ntTSL 412.92□□□□□ -0.342e-7■■■■■ 102.1
RBFOX2O43251 CYFIP1-207ENST00000617556 5674 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.771e-10■■■■■ 100.3
RBFOX2O43251 NKTR-209ENST00000465584 3839 ntTSL 21.98□□□□□ -2.091e-14■■■■■ 100
RBFOX2O43251 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.224e-7■■■■■ 99.9
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