Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLXNB1O43157 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PLXNB1O43157 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNB1O43157 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNB1O43157 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNB1O43157 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNB1O43157 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNB1O43157 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNB1O43157 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNB1O43157 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNB1O43157 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNB1O43157 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLXNB1O43157 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLXNB1O43157 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXNB1O43157 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXNB1O43157 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNB1O43157 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNB1O43157 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNB1O43157 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNB1O43157 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNB1O43157 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNB1O43157 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNB1O43157 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PLXNB1O43157 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNB1O43157 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNB1O43157 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNB1O43157 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNB1O43157 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNB1O43157 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNB1O43157 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNB1O43157 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNB1O43157 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXNB1O43157 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXNB1O43157 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PLXNB1O43157 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNB1O43157 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNB1O43157 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNB1O43157 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNB1O43157 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNB1O43157 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNB1O43157 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNB1O43157 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNB1O43157 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNB1O43157 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNB1O43157 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNB1O43157 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNB1O43157 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNB1O43157 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNB1O43157 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNB1O43157 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNB1O43157 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNB1O43157 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNB1O43157 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNB1O43157 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNB1O43157 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNB1O43157 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNB1O43157 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNB1O43157 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNB1O43157 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNB1O43157 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXNB1O43157 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNB1O43157 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNB1O43157 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNB1O43157 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNB1O43157 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNB1O43157 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLXNB1O43157 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLXNB1O43157 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXNB1O43157 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXNB1O43157 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNB1O43157 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNB1O43157 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXNB1O43157 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXNB1O43157 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXNB1O43157 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNB1O43157 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXNB1O43157 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNB1O43157 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNB1O43157 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNB1O43157 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNB1O43157 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNB1O43157 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNB1O43157 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNB1O43157 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLXNB1O43157 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXNB1O43157 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXNB1O43157 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXNB1O43157 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXNB1O43157 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNB1O43157 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNB1O43157 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNB1O43157 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNB1O43157 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNB1O43157 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNB1O43157 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXNB1O43157 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNB1O43157 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNB1O43157 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNB1O43157 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNB1O43157 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms