Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLOCKO15516 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLOCKO15516 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLOCKO15516 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLOCKO15516 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLOCKO15516 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLOCKO15516 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLOCKO15516 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLOCKO15516 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLOCKO15516 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLOCKO15516 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLOCKO15516 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLOCKO15516 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLOCKO15516 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLOCKO15516 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLOCKO15516 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLOCKO15516 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLOCKO15516 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CLOCKO15516 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLOCKO15516 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CLOCKO15516 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLOCKO15516 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CLOCKO15516 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLOCKO15516 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLOCKO15516 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLOCKO15516 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLOCKO15516 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLOCKO15516 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLOCKO15516 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLOCKO15516 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLOCKO15516 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLOCKO15516 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLOCKO15516 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLOCKO15516 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLOCKO15516 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLOCKO15516 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLOCKO15516 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLOCKO15516 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLOCKO15516 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLOCKO15516 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLOCKO15516 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLOCKO15516 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLOCKO15516 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLOCKO15516 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLOCKO15516 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLOCKO15516 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLOCKO15516 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLOCKO15516 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLOCKO15516 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLOCKO15516 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLOCKO15516 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLOCKO15516 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLOCKO15516 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLOCKO15516 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLOCKO15516 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLOCKO15516 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLOCKO15516 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLOCKO15516 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLOCKO15516 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLOCKO15516 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLOCKO15516 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLOCKO15516 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLOCKO15516 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLOCKO15516 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLOCKO15516 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLOCKO15516 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLOCKO15516 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLOCKO15516 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLOCKO15516 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLOCKO15516 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLOCKO15516 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLOCKO15516 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLOCKO15516 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLOCKO15516 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLOCKO15516 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLOCKO15516 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLOCKO15516 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLOCKO15516 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLOCKO15516 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CLOCKO15516 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLOCKO15516 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLOCKO15516 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLOCKO15516 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLOCKO15516 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLOCKO15516 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLOCKO15516 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLOCKO15516 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLOCKO15516 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CLOCKO15516 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLOCKO15516 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLOCKO15516 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLOCKO15516 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLOCKO15516 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLOCKO15516 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLOCKO15516 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CLOCKO15516 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLOCKO15516 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLOCKO15516 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLOCKO15516 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLOCKO15516 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 539.3 ms