Protein–RNA interactions for Protein: O15273

TCAP, Telethonin, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAPO15273 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCAPO15273 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCAPO15273 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCAPO15273 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCAPO15273 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCAPO15273 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCAPO15273 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TCAPO15273 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCAPO15273 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCAPO15273 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCAPO15273 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCAPO15273 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCAPO15273 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TCAPO15273 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCAPO15273 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCAPO15273 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCAPO15273 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCAPO15273 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCAPO15273 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCAPO15273 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCAPO15273 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCAPO15273 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCAPO15273 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCAPO15273 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCAPO15273 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCAPO15273 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCAPO15273 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCAPO15273 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCAPO15273 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCAPO15273 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCAPO15273 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCAPO15273 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCAPO15273 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCAPO15273 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCAPO15273 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCAPO15273 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCAPO15273 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCAPO15273 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCAPO15273 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCAPO15273 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCAPO15273 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCAPO15273 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TCAPO15273 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TCAPO15273 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCAPO15273 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TCAPO15273 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCAPO15273 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TCAPO15273 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TCAPO15273 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCAPO15273 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCAPO15273 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCAPO15273 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCAPO15273 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCAPO15273 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TCAPO15273 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TCAPO15273 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TCAPO15273 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCAPO15273 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TCAPO15273 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TCAPO15273 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCAPO15273 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCAPO15273 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCAPO15273 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCAPO15273 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCAPO15273 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCAPO15273 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCAPO15273 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCAPO15273 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCAPO15273 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCAPO15273 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCAPO15273 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TCAPO15273 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCAPO15273 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCAPO15273 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCAPO15273 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCAPO15273 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TCAPO15273 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TCAPO15273 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCAPO15273 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCAPO15273 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCAPO15273 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCAPO15273 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCAPO15273 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCAPO15273 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TCAPO15273 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TCAPO15273 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TCAPO15273 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TCAPO15273 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TCAPO15273 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCAPO15273 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCAPO15273 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCAPO15273 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCAPO15273 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCAPO15273 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCAPO15273 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCAPO15273 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCAPO15273 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCAPO15273 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCAPO15273 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCAPO15273 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms