Protein–RNA interactions for Protein: O15273

TCAP, Telethonin, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAPO15273 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCAPO15273 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCAPO15273 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCAPO15273 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCAPO15273 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCAPO15273 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCAPO15273 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TCAPO15273 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCAPO15273 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCAPO15273 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCAPO15273 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCAPO15273 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCAPO15273 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TCAPO15273 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCAPO15273 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCAPO15273 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCAPO15273 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCAPO15273 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCAPO15273 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCAPO15273 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCAPO15273 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCAPO15273 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCAPO15273 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCAPO15273 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCAPO15273 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCAPO15273 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCAPO15273 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCAPO15273 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCAPO15273 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCAPO15273 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCAPO15273 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCAPO15273 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCAPO15273 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCAPO15273 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCAPO15273 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCAPO15273 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCAPO15273 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCAPO15273 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCAPO15273 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCAPO15273 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCAPO15273 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCAPO15273 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TCAPO15273 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TCAPO15273 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCAPO15273 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TCAPO15273 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCAPO15273 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TCAPO15273 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TCAPO15273 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCAPO15273 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCAPO15273 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCAPO15273 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCAPO15273 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCAPO15273 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TCAPO15273 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TCAPO15273 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TCAPO15273 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCAPO15273 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TCAPO15273 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TCAPO15273 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCAPO15273 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCAPO15273 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCAPO15273 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCAPO15273 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCAPO15273 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCAPO15273 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCAPO15273 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCAPO15273 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCAPO15273 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCAPO15273 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCAPO15273 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TCAPO15273 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCAPO15273 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCAPO15273 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCAPO15273 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCAPO15273 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TCAPO15273 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TCAPO15273 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCAPO15273 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCAPO15273 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCAPO15273 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCAPO15273 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCAPO15273 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCAPO15273 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TCAPO15273 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TCAPO15273 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TCAPO15273 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TCAPO15273 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TCAPO15273 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCAPO15273 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCAPO15273 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCAPO15273 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCAPO15273 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCAPO15273 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCAPO15273 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCAPO15273 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCAPO15273 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCAPO15273 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCAPO15273 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCAPO15273 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms