Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LAMA5O15230 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LAMA5O15230 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMA5O15230 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMA5O15230 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMA5O15230 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LAMA5O15230 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LAMA5O15230 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMA5O15230 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMA5O15230 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMA5O15230 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMA5O15230 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMA5O15230 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMA5O15230 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMA5O15230 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMA5O15230 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMA5O15230 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMA5O15230 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMA5O15230 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMA5O15230 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMA5O15230 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMA5O15230 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMA5O15230 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMA5O15230 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMA5O15230 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMA5O15230 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMA5O15230 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMA5O15230 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMA5O15230 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMA5O15230 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMA5O15230 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMA5O15230 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMA5O15230 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LAMA5O15230 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LAMA5O15230 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
LAMA5O15230 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LAMA5O15230 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LAMA5O15230 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LAMA5O15230 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LAMA5O15230 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LAMA5O15230 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMA5O15230 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LAMA5O15230 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMA5O15230 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMA5O15230 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMA5O15230 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMA5O15230 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMA5O15230 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMA5O15230 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMA5O15230 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LAMA5O15230 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMA5O15230 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMA5O15230 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMA5O15230 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMA5O15230 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMA5O15230 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMA5O15230 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMA5O15230 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMA5O15230 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMA5O15230 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMA5O15230 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMA5O15230 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LAMA5O15230 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LAMA5O15230 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMA5O15230 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMA5O15230 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMA5O15230 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMA5O15230 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMA5O15230 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMA5O15230 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMA5O15230 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMA5O15230 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMA5O15230 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMA5O15230 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LAMA5O15230 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LAMA5O15230 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMA5O15230 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMA5O15230 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMA5O15230 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
LAMA5O15230 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMA5O15230 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMA5O15230 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMA5O15230 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAMA5O15230 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMA5O15230 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMA5O15230 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMA5O15230 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LAMA5O15230 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LAMA5O15230 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LAMA5O15230 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMA5O15230 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMA5O15230 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAMA5O15230 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAMA5O15230 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMA5O15230 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMA5O15230 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMA5O15230 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LAMA5O15230 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMA5O15230 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMA5O15230 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 333.5 ms