Protein–RNA interactions for Protein: O00408

PDE2A, cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE2AO00408 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PDE2AO00408 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PDE2AO00408 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PDE2AO00408 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PDE2AO00408 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PDE2AO00408 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PDE2AO00408 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PDE2AO00408 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PDE2AO00408 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PDE2AO00408 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PDE2AO00408 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PDE2AO00408 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PDE2AO00408 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PDE2AO00408 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PDE2AO00408 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PDE2AO00408 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
PDE2AO00408 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDE2AO00408 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PDE2AO00408 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PDE2AO00408 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDE2AO00408 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDE2AO00408 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDE2AO00408 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PDE2AO00408 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PDE2AO00408 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PDE2AO00408 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PDE2AO00408 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PDE2AO00408 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PDE2AO00408 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PDE2AO00408 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PDE2AO00408 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PDE2AO00408 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PDE2AO00408 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PDE2AO00408 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PDE2AO00408 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDE2AO00408 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDE2AO00408 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDE2AO00408 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PDE2AO00408 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PDE2AO00408 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PDE2AO00408 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PDE2AO00408 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PDE2AO00408 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PDE2AO00408 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PDE2AO00408 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PDE2AO00408 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PDE2AO00408 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PDE2AO00408 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PDE2AO00408 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PDE2AO00408 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PDE2AO00408 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PDE2AO00408 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PDE2AO00408 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PDE2AO00408 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PDE2AO00408 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PDE2AO00408 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PDE2AO00408 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PDE2AO00408 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDE2AO00408 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDE2AO00408 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PDE2AO00408 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDE2AO00408 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDE2AO00408 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDE2AO00408 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDE2AO00408 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PDE2AO00408 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDE2AO00408 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDE2AO00408 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDE2AO00408 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDE2AO00408 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PDE2AO00408 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PDE2AO00408 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDE2AO00408 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PDE2AO00408 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDE2AO00408 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDE2AO00408 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDE2AO00408 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDE2AO00408 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDE2AO00408 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDE2AO00408 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDE2AO00408 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
PDE2AO00408 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PDE2AO00408 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDE2AO00408 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDE2AO00408 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDE2AO00408 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDE2AO00408 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDE2AO00408 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PDE2AO00408 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDE2AO00408 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDE2AO00408 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDE2AO00408 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDE2AO00408 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDE2AO00408 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDE2AO00408 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDE2AO00408 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDE2AO00408 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDE2AO00408 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDE2AO00408 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDE2AO00408 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms