Protein–RNA interactions for Protein: O00339

MATN2, Matrilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN2O00339 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MATN2O00339 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MATN2O00339 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MATN2O00339 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MATN2O00339 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MATN2O00339 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MATN2O00339 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MATN2O00339 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MATN2O00339 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MATN2O00339 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MATN2O00339 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MATN2O00339 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MATN2O00339 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MATN2O00339 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MATN2O00339 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MATN2O00339 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MATN2O00339 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MATN2O00339 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MATN2O00339 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MATN2O00339 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MATN2O00339 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MATN2O00339 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MATN2O00339 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MATN2O00339 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MATN2O00339 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MATN2O00339 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MATN2O00339 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
MATN2O00339 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MATN2O00339 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MATN2O00339 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MATN2O00339 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MATN2O00339 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MATN2O00339 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MATN2O00339 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MATN2O00339 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MATN2O00339 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MATN2O00339 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MATN2O00339 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MATN2O00339 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MATN2O00339 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MATN2O00339 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MATN2O00339 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MATN2O00339 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MATN2O00339 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MATN2O00339 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MATN2O00339 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MATN2O00339 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MATN2O00339 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MATN2O00339 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MATN2O00339 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MATN2O00339 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MATN2O00339 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MATN2O00339 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MATN2O00339 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MATN2O00339 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MATN2O00339 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MATN2O00339 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MATN2O00339 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MATN2O00339 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MATN2O00339 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MATN2O00339 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MATN2O00339 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MATN2O00339 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MATN2O00339 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MATN2O00339 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MATN2O00339 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MATN2O00339 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MATN2O00339 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MATN2O00339 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MATN2O00339 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MATN2O00339 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MATN2O00339 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MATN2O00339 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MATN2O00339 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MATN2O00339 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MATN2O00339 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MATN2O00339 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MATN2O00339 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MATN2O00339 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MATN2O00339 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MATN2O00339 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MATN2O00339 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MATN2O00339 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MATN2O00339 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MATN2O00339 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MATN2O00339 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MATN2O00339 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MATN2O00339 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MATN2O00339 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MATN2O00339 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MATN2O00339 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MATN2O00339 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MATN2O00339 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MATN2O00339 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MATN2O00339 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MATN2O00339 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MATN2O00339 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MATN2O00339 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MATN2O00339 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MATN2O00339 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms