Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
AP3B1O00203 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
AP3B1O00203 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
AP3B1O00203 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
AP3B1O00203 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
AP3B1O00203 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AP3B1O00203 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AP3B1O00203 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
AP3B1O00203 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AP3B1O00203 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
AP3B1O00203 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
AP3B1O00203 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
AP3B1O00203 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
AP3B1O00203 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
AP3B1O00203 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
AP3B1O00203 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AP3B1O00203 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AP3B1O00203 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
AP3B1O00203 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AP3B1O00203 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
AP3B1O00203 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AP3B1O00203 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
AP3B1O00203 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AP3B1O00203 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
AP3B1O00203 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
AP3B1O00203 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AP3B1O00203 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
AP3B1O00203 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
AP3B1O00203 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
AP3B1O00203 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
AP3B1O00203 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AP3B1O00203 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AP3B1O00203 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AP3B1O00203 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AP3B1O00203 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
AP3B1O00203 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
AP3B1O00203 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
AP3B1O00203 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AP3B1O00203 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AP3B1O00203 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AP3B1O00203 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AP3B1O00203 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
AP3B1O00203 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
AP3B1O00203 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
AP3B1O00203 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AP3B1O00203 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
AP3B1O00203 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
AP3B1O00203 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
AP3B1O00203 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
AP3B1O00203 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
AP3B1O00203 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
AP3B1O00203 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
AP3B1O00203 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
AP3B1O00203 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
AP3B1O00203 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AP3B1O00203 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
AP3B1O00203 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
AP3B1O00203 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AP3B1O00203 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
AP3B1O00203 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AP3B1O00203 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AP3B1O00203 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
AP3B1O00203 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AP3B1O00203 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
AP3B1O00203 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
AP3B1O00203 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AP3B1O00203 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AP3B1O00203 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AP3B1O00203 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AP3B1O00203 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AP3B1O00203 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AP3B1O00203 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AP3B1O00203 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
AP3B1O00203 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AP3B1O00203 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AP3B1O00203 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AP3B1O00203 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AP3B1O00203 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AP3B1O00203 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AP3B1O00203 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AP3B1O00203 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AP3B1O00203 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AP3B1O00203 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
AP3B1O00203 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AP3B1O00203 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AP3B1O00203 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
AP3B1O00203 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AP3B1O00203 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AP3B1O00203 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AP3B1O00203 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
AP3B1O00203 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AP3B1O00203 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
AP3B1O00203 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
AP3B1O00203 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
AP3B1O00203 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
AP3B1O00203 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AP3B1O00203 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AP3B1O00203 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AP3B1O00203 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AP3B1O00203 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms