Protein–RNA interactions for Protein: O00115

DNASE2, Deoxyribonuclease-2-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE2O00115 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNASE2O00115 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNASE2O00115 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNASE2O00115 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNASE2O00115 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNASE2O00115 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNASE2O00115 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNASE2O00115 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNASE2O00115 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNASE2O00115 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNASE2O00115 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNASE2O00115 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNASE2O00115 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNASE2O00115 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNASE2O00115 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNASE2O00115 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNASE2O00115 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNASE2O00115 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNASE2O00115 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNASE2O00115 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNASE2O00115 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNASE2O00115 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNASE2O00115 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNASE2O00115 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNASE2O00115 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNASE2O00115 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNASE2O00115 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNASE2O00115 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNASE2O00115 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNASE2O00115 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNASE2O00115 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNASE2O00115 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNASE2O00115 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNASE2O00115 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNASE2O00115 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNASE2O00115 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNASE2O00115 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNASE2O00115 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNASE2O00115 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNASE2O00115 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNASE2O00115 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNASE2O00115 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNASE2O00115 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNASE2O00115 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNASE2O00115 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNASE2O00115 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNASE2O00115 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNASE2O00115 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNASE2O00115 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNASE2O00115 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNASE2O00115 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNASE2O00115 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNASE2O00115 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNASE2O00115 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNASE2O00115 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNASE2O00115 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNASE2O00115 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNASE2O00115 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNASE2O00115 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNASE2O00115 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNASE2O00115 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNASE2O00115 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNASE2O00115 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNASE2O00115 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNASE2O00115 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNASE2O00115 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNASE2O00115 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNASE2O00115 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNASE2O00115 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNASE2O00115 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNASE2O00115 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNASE2O00115 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNASE2O00115 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNASE2O00115 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNASE2O00115 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNASE2O00115 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNASE2O00115 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNASE2O00115 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNASE2O00115 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNASE2O00115 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNASE2O00115 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNASE2O00115 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DNASE2O00115 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNASE2O00115 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNASE2O00115 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNASE2O00115 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNASE2O00115 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNASE2O00115 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNASE2O00115 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNASE2O00115 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DNASE2O00115 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNASE2O00115 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNASE2O00115 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNASE2O00115 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNASE2O00115 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNASE2O00115 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNASE2O00115 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DNASE2O00115 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNASE2O00115 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNASE2O00115 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms