Protein–RNA interactions for Protein: E9PQX1

TMEM262, Transmembrane protein 262, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM262E9PQX1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM262E9PQX1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM262E9PQX1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM262E9PQX1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM262E9PQX1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM262E9PQX1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM262E9PQX1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM262E9PQX1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM262E9PQX1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM262E9PQX1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM262E9PQX1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM262E9PQX1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM262E9PQX1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM262E9PQX1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM262E9PQX1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM262E9PQX1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM262E9PQX1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM262E9PQX1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM262E9PQX1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM262E9PQX1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM262E9PQX1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM262E9PQX1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM262E9PQX1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM262E9PQX1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM262E9PQX1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM262E9PQX1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM262E9PQX1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM262E9PQX1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM262E9PQX1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM262E9PQX1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM262E9PQX1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM262E9PQX1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM262E9PQX1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM262E9PQX1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TMEM262E9PQX1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM262E9PQX1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM262E9PQX1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM262E9PQX1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM262E9PQX1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM262E9PQX1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM262E9PQX1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM262E9PQX1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM262E9PQX1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM262E9PQX1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM262E9PQX1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM262E9PQX1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM262E9PQX1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM262E9PQX1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM262E9PQX1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM262E9PQX1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM262E9PQX1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM262E9PQX1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM262E9PQX1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM262E9PQX1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM262E9PQX1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM262E9PQX1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM262E9PQX1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM262E9PQX1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM262E9PQX1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TMEM262E9PQX1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM262E9PQX1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM262E9PQX1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM262E9PQX1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM262E9PQX1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM262E9PQX1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMEM262E9PQX1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMEM262E9PQX1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMEM262E9PQX1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMEM262E9PQX1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM262E9PQX1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM262E9PQX1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM262E9PQX1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM262E9PQX1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM262E9PQX1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM262E9PQX1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMEM262E9PQX1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMEM262E9PQX1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMEM262E9PQX1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM262E9PQX1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM262E9PQX1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM262E9PQX1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM262E9PQX1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM262E9PQX1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM262E9PQX1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM262E9PQX1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM262E9PQX1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM262E9PQX1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM262E9PQX1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM262E9PQX1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM262E9PQX1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM262E9PQX1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM262E9PQX1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM262E9PQX1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM262E9PQX1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM262E9PQX1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM262E9PQX1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM262E9PQX1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM262E9PQX1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM262E9PQX1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM262E9PQX1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms