Protein–RNA interactions for Protein: E9PJ23

NPIPB6, Nuclear pore complex-interacting protein family member B6, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB6E9PJ23 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPIPB6E9PJ23 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPIPB6E9PJ23 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPIPB6E9PJ23 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPIPB6E9PJ23 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPIPB6E9PJ23 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPIPB6E9PJ23 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPB6E9PJ23 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPB6E9PJ23 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPB6E9PJ23 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPB6E9PJ23 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPIPB6E9PJ23 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPB6E9PJ23 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPB6E9PJ23 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPIPB6E9PJ23 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPB6E9PJ23 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPB6E9PJ23 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPB6E9PJ23 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPIPB6E9PJ23 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NPIPB6E9PJ23 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPIPB6E9PJ23 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPIPB6E9PJ23 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPIPB6E9PJ23 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPIPB6E9PJ23 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NPIPB6E9PJ23 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NPIPB6E9PJ23 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPIPB6E9PJ23 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPIPB6E9PJ23 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPIPB6E9PJ23 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPIPB6E9PJ23 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPIPB6E9PJ23 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPIPB6E9PJ23 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPIPB6E9PJ23 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPIPB6E9PJ23 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPIPB6E9PJ23 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPIPB6E9PJ23 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPIPB6E9PJ23 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPIPB6E9PJ23 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPIPB6E9PJ23 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NPIPB6E9PJ23 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPIPB6E9PJ23 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPIPB6E9PJ23 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPIPB6E9PJ23 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPIPB6E9PJ23 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPIPB6E9PJ23 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPIPB6E9PJ23 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPIPB6E9PJ23 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPIPB6E9PJ23 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPIPB6E9PJ23 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPIPB6E9PJ23 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPIPB6E9PJ23 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPB6E9PJ23 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPB6E9PJ23 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPIPB6E9PJ23 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB6E9PJ23 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB6E9PJ23 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPIPB6E9PJ23 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPB6E9PJ23 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPB6E9PJ23 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPB6E9PJ23 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPB6E9PJ23 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPB6E9PJ23 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPIPB6E9PJ23 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPB6E9PJ23 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPB6E9PJ23 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB6E9PJ23 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPIPB6E9PJ23 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPIPB6E9PJ23 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPIPB6E9PJ23 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB6E9PJ23 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB6E9PJ23 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB6E9PJ23 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB6E9PJ23 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB6E9PJ23 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPB6E9PJ23 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPB6E9PJ23 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPB6E9PJ23 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPB6E9PJ23 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPB6E9PJ23 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPB6E9PJ23 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPB6E9PJ23 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPB6E9PJ23 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPB6E9PJ23 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPB6E9PJ23 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPB6E9PJ23 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPB6E9PJ23 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB6E9PJ23 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPB6E9PJ23 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPB6E9PJ23 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NPIPB6E9PJ23 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPB6E9PJ23 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPB6E9PJ23 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPB6E9PJ23 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPB6E9PJ23 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB6E9PJ23 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPIPB6E9PJ23 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPIPB6E9PJ23 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPIPB6E9PJ23 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPIPB6E9PJ23 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPIPB6E9PJ23 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms