Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCRIP1C9JLW8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCRIP1C9JLW8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCRIP1C9JLW8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCRIP1C9JLW8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCRIP1C9JLW8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCRIP1C9JLW8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCRIP1C9JLW8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCRIP1C9JLW8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCRIP1C9JLW8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCRIP1C9JLW8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCRIP1C9JLW8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCRIP1C9JLW8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCRIP1C9JLW8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCRIP1C9JLW8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCRIP1C9JLW8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCRIP1C9JLW8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCRIP1C9JLW8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCRIP1C9JLW8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCRIP1C9JLW8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCRIP1C9JLW8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MCRIP1C9JLW8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCRIP1C9JLW8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCRIP1C9JLW8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCRIP1C9JLW8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCRIP1C9JLW8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCRIP1C9JLW8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCRIP1C9JLW8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCRIP1C9JLW8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCRIP1C9JLW8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCRIP1C9JLW8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCRIP1C9JLW8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCRIP1C9JLW8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCRIP1C9JLW8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCRIP1C9JLW8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MCRIP1C9JLW8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCRIP1C9JLW8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCRIP1C9JLW8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCRIP1C9JLW8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCRIP1C9JLW8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCRIP1C9JLW8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCRIP1C9JLW8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCRIP1C9JLW8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCRIP1C9JLW8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCRIP1C9JLW8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCRIP1C9JLW8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCRIP1C9JLW8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCRIP1C9JLW8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCRIP1C9JLW8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCRIP1C9JLW8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCRIP1C9JLW8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCRIP1C9JLW8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCRIP1C9JLW8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCRIP1C9JLW8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCRIP1C9JLW8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCRIP1C9JLW8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCRIP1C9JLW8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCRIP1C9JLW8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCRIP1C9JLW8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCRIP1C9JLW8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCRIP1C9JLW8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCRIP1C9JLW8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCRIP1C9JLW8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCRIP1C9JLW8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCRIP1C9JLW8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCRIP1C9JLW8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCRIP1C9JLW8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCRIP1C9JLW8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCRIP1C9JLW8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCRIP1C9JLW8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCRIP1C9JLW8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCRIP1C9JLW8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCRIP1C9JLW8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCRIP1C9JLW8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCRIP1C9JLW8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCRIP1C9JLW8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCRIP1C9JLW8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCRIP1C9JLW8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MCRIP1C9JLW8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCRIP1C9JLW8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCRIP1C9JLW8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCRIP1C9JLW8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCRIP1C9JLW8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCRIP1C9JLW8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCRIP1C9JLW8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCRIP1C9JLW8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCRIP1C9JLW8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCRIP1C9JLW8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCRIP1C9JLW8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCRIP1C9JLW8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCRIP1C9JLW8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCRIP1C9JLW8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCRIP1C9JLW8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCRIP1C9JLW8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCRIP1C9JLW8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCRIP1C9JLW8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCRIP1C9JLW8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCRIP1C9JLW8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MCRIP1C9JLW8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCRIP1C9JLW8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms