Protein–RNA interactions for Protein: A8KAH6

HSPB2, Heat shock 27kDa protein 2, isoform CRA_a, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB2A8KAH6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HSPB2A8KAH6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSPB2A8KAH6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSPB2A8KAH6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HSPB2A8KAH6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSPB2A8KAH6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSPB2A8KAH6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSPB2A8KAH6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSPB2A8KAH6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HSPB2A8KAH6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HSPB2A8KAH6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HSPB2A8KAH6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSPB2A8KAH6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSPB2A8KAH6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HSPB2A8KAH6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSPB2A8KAH6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSPB2A8KAH6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSPB2A8KAH6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSPB2A8KAH6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HSPB2A8KAH6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HSPB2A8KAH6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HSPB2A8KAH6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HSPB2A8KAH6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HSPB2A8KAH6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HSPB2A8KAH6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HSPB2A8KAH6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HSPB2A8KAH6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HSPB2A8KAH6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HSPB2A8KAH6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HSPB2A8KAH6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HSPB2A8KAH6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HSPB2A8KAH6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HSPB2A8KAH6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HSPB2A8KAH6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HSPB2A8KAH6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HSPB2A8KAH6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HSPB2A8KAH6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HSPB2A8KAH6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HSPB2A8KAH6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HSPB2A8KAH6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HSPB2A8KAH6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HSPB2A8KAH6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HSPB2A8KAH6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HSPB2A8KAH6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HSPB2A8KAH6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HSPB2A8KAH6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HSPB2A8KAH6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HSPB2A8KAH6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HSPB2A8KAH6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HSPB2A8KAH6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HSPB2A8KAH6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HSPB2A8KAH6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HSPB2A8KAH6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HSPB2A8KAH6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HSPB2A8KAH6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HSPB2A8KAH6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HSPB2A8KAH6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HSPB2A8KAH6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HSPB2A8KAH6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HSPB2A8KAH6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HSPB2A8KAH6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HSPB2A8KAH6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSPB2A8KAH6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSPB2A8KAH6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HSPB2A8KAH6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HSPB2A8KAH6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HSPB2A8KAH6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HSPB2A8KAH6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HSPB2A8KAH6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HSPB2A8KAH6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSPB2A8KAH6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSPB2A8KAH6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSPB2A8KAH6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSPB2A8KAH6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSPB2A8KAH6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSPB2A8KAH6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSPB2A8KAH6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSPB2A8KAH6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSPB2A8KAH6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HSPB2A8KAH6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSPB2A8KAH6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSPB2A8KAH6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSPB2A8KAH6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSPB2A8KAH6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSPB2A8KAH6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSPB2A8KAH6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSPB2A8KAH6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSPB2A8KAH6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSPB2A8KAH6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSPB2A8KAH6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSPB2A8KAH6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSPB2A8KAH6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSPB2A8KAH6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSPB2A8KAH6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSPB2A8KAH6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSPB2A8KAH6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSPB2A8KAH6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSPB2A8KAH6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HSPB2A8KAH6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HSPB2A8KAH6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms