Protein–RNA interactions for Protein: A6NHL2

TUBAL3, Tubulin alpha chain-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBAL3A6NHL2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBAL3A6NHL2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBAL3A6NHL2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBAL3A6NHL2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBAL3A6NHL2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBAL3A6NHL2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBAL3A6NHL2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBAL3A6NHL2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBAL3A6NHL2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBAL3A6NHL2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBAL3A6NHL2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBAL3A6NHL2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBAL3A6NHL2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBAL3A6NHL2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBAL3A6NHL2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBAL3A6NHL2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBAL3A6NHL2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBAL3A6NHL2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBAL3A6NHL2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBAL3A6NHL2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBAL3A6NHL2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBAL3A6NHL2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TUBAL3A6NHL2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBAL3A6NHL2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBAL3A6NHL2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBAL3A6NHL2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBAL3A6NHL2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBAL3A6NHL2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBAL3A6NHL2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBAL3A6NHL2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBAL3A6NHL2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBAL3A6NHL2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBAL3A6NHL2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBAL3A6NHL2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBAL3A6NHL2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBAL3A6NHL2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBAL3A6NHL2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBAL3A6NHL2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBAL3A6NHL2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBAL3A6NHL2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBAL3A6NHL2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBAL3A6NHL2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBAL3A6NHL2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBAL3A6NHL2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBAL3A6NHL2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBAL3A6NHL2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBAL3A6NHL2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBAL3A6NHL2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBAL3A6NHL2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBAL3A6NHL2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBAL3A6NHL2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBAL3A6NHL2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBAL3A6NHL2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBAL3A6NHL2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBAL3A6NHL2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBAL3A6NHL2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBAL3A6NHL2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBAL3A6NHL2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBAL3A6NHL2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBAL3A6NHL2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBAL3A6NHL2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBAL3A6NHL2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBAL3A6NHL2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBAL3A6NHL2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBAL3A6NHL2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBAL3A6NHL2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBAL3A6NHL2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBAL3A6NHL2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBAL3A6NHL2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBAL3A6NHL2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBAL3A6NHL2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBAL3A6NHL2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBAL3A6NHL2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBAL3A6NHL2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBAL3A6NHL2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBAL3A6NHL2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBAL3A6NHL2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBAL3A6NHL2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBAL3A6NHL2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBAL3A6NHL2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBAL3A6NHL2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBAL3A6NHL2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBAL3A6NHL2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBAL3A6NHL2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBAL3A6NHL2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBAL3A6NHL2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBAL3A6NHL2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBAL3A6NHL2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBAL3A6NHL2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBAL3A6NHL2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBAL3A6NHL2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBAL3A6NHL2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBAL3A6NHL2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBAL3A6NHL2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBAL3A6NHL2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBAL3A6NHL2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBAL3A6NHL2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBAL3A6NHL2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBAL3A6NHL2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBAL3A6NHL2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms