Protein–RNA interactions for Protein: A6NH11

GLTPD2, Glycolipid transfer protein domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLTPD2A6NH11 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
GLTPD2A6NH11 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
GLTPD2A6NH11 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
GLTPD2A6NH11 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
GLTPD2A6NH11 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
GLTPD2A6NH11 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
GLTPD2A6NH11 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
GLTPD2A6NH11 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
GLTPD2A6NH11 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
GLTPD2A6NH11 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
GLTPD2A6NH11 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
GLTPD2A6NH11 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
GLTPD2A6NH11 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
GLTPD2A6NH11 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
GLTPD2A6NH11 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
GLTPD2A6NH11 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC36■■■■□ 3.35
GLTPD2A6NH11 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC35.98■■■■□ 3.35
GLTPD2A6NH11 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
GLTPD2A6NH11 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
GLTPD2A6NH11 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
GLTPD2A6NH11 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
GLTPD2A6NH11 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
GLTPD2A6NH11 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
GLTPD2A6NH11 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
GLTPD2A6NH11 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
GLTPD2A6NH11 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
GLTPD2A6NH11 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
GLTPD2A6NH11 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
GLTPD2A6NH11 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
GLTPD2A6NH11 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
GLTPD2A6NH11 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
GLTPD2A6NH11 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
GLTPD2A6NH11 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
GLTPD2A6NH11 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
GLTPD2A6NH11 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
GLTPD2A6NH11 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
GLTPD2A6NH11 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
GLTPD2A6NH11 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
GLTPD2A6NH11 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
GLTPD2A6NH11 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
GLTPD2A6NH11 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
GLTPD2A6NH11 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
GLTPD2A6NH11 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
GLTPD2A6NH11 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
GLTPD2A6NH11 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
GLTPD2A6NH11 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
GLTPD2A6NH11 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
GLTPD2A6NH11 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
GLTPD2A6NH11 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
GLTPD2A6NH11 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
GLTPD2A6NH11 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
GLTPD2A6NH11 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
GLTPD2A6NH11 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
GLTPD2A6NH11 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
GLTPD2A6NH11 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
GLTPD2A6NH11 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
GLTPD2A6NH11 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
GLTPD2A6NH11 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
GLTPD2A6NH11 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
GLTPD2A6NH11 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
GLTPD2A6NH11 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
GLTPD2A6NH11 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
GLTPD2A6NH11 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
GLTPD2A6NH11 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
GLTPD2A6NH11 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
GLTPD2A6NH11 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
GLTPD2A6NH11 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
GLTPD2A6NH11 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
GLTPD2A6NH11 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
GLTPD2A6NH11 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
GLTPD2A6NH11 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
GLTPD2A6NH11 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
GLTPD2A6NH11 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
GLTPD2A6NH11 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
GLTPD2A6NH11 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
GLTPD2A6NH11 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
GLTPD2A6NH11 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
GLTPD2A6NH11 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC35.06■■■■□ 3.2
GLTPD2A6NH11 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
GLTPD2A6NH11 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
GLTPD2A6NH11 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
GLTPD2A6NH11 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
GLTPD2A6NH11 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
GLTPD2A6NH11 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
GLTPD2A6NH11 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GLTPD2A6NH11 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
GLTPD2A6NH11 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
GLTPD2A6NH11 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
GLTPD2A6NH11 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
GLTPD2A6NH11 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
GLTPD2A6NH11 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
GLTPD2A6NH11 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
GLTPD2A6NH11 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
GLTPD2A6NH11 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
GLTPD2A6NH11 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
GLTPD2A6NH11 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
GLTPD2A6NH11 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
GLTPD2A6NH11 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
GLTPD2A6NH11 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
GLTPD2A6NH11 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms