Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAMEF25A6NGN4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRAMEF25A6NGN4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRAMEF25A6NGN4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRAMEF25A6NGN4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRAMEF25A6NGN4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRAMEF25A6NGN4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRAMEF25A6NGN4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PRAMEF25A6NGN4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRAMEF25A6NGN4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAMEF25A6NGN4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAMEF25A6NGN4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF25A6NGN4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF25A6NGN4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF25A6NGN4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRAMEF25A6NGN4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PRAMEF25A6NGN4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRAMEF25A6NGN4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAMEF25A6NGN4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAMEF25A6NGN4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF25A6NGN4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF25A6NGN4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRAMEF25A6NGN4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAMEF25A6NGN4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAMEF25A6NGN4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRAMEF25A6NGN4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRAMEF25A6NGN4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRAMEF25A6NGN4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRAMEF25A6NGN4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRAMEF25A6NGN4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRAMEF25A6NGN4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRAMEF25A6NGN4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRAMEF25A6NGN4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRAMEF25A6NGN4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRAMEF25A6NGN4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRAMEF25A6NGN4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRAMEF25A6NGN4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRAMEF25A6NGN4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRAMEF25A6NGN4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRAMEF25A6NGN4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRAMEF25A6NGN4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRAMEF25A6NGN4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRAMEF25A6NGN4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRAMEF25A6NGN4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRAMEF25A6NGN4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRAMEF25A6NGN4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRAMEF25A6NGN4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRAMEF25A6NGN4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRAMEF25A6NGN4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRAMEF25A6NGN4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRAMEF25A6NGN4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRAMEF25A6NGN4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRAMEF25A6NGN4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRAMEF25A6NGN4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PRAMEF25A6NGN4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRAMEF25A6NGN4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRAMEF25A6NGN4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRAMEF25A6NGN4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRAMEF25A6NGN4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRAMEF25A6NGN4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRAMEF25A6NGN4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRAMEF25A6NGN4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRAMEF25A6NGN4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRAMEF25A6NGN4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRAMEF25A6NGN4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRAMEF25A6NGN4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRAMEF25A6NGN4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRAMEF25A6NGN4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRAMEF25A6NGN4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRAMEF25A6NGN4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRAMEF25A6NGN4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRAMEF25A6NGN4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRAMEF25A6NGN4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRAMEF25A6NGN4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRAMEF25A6NGN4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRAMEF25A6NGN4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRAMEF25A6NGN4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRAMEF25A6NGN4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PRAMEF25A6NGN4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRAMEF25A6NGN4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEF25A6NGN4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRAMEF25A6NGN4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRAMEF25A6NGN4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRAMEF25A6NGN4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRAMEF25A6NGN4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRAMEF25A6NGN4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRAMEF25A6NGN4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRAMEF25A6NGN4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRAMEF25A6NGN4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRAMEF25A6NGN4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRAMEF25A6NGN4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRAMEF25A6NGN4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRAMEF25A6NGN4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRAMEF25A6NGN4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF25A6NGN4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF25A6NGN4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF25A6NGN4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF25A6NGN4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF25A6NGN4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF25A6NGN4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms