Protein–RNA interactions for Protein: A5X5Y0

HTR3E, 5-hydroxytryptamine receptor 3E, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR3EA5X5Y0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HTR3EA5X5Y0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HTR3EA5X5Y0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HTR3EA5X5Y0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HTR3EA5X5Y0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HTR3EA5X5Y0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HTR3EA5X5Y0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
HTR3EA5X5Y0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HTR3EA5X5Y0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HTR3EA5X5Y0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HTR3EA5X5Y0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HTR3EA5X5Y0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HTR3EA5X5Y0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HTR3EA5X5Y0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HTR3EA5X5Y0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HTR3EA5X5Y0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HTR3EA5X5Y0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTR3EA5X5Y0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HTR3EA5X5Y0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HTR3EA5X5Y0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HTR3EA5X5Y0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HTR3EA5X5Y0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HTR3EA5X5Y0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HTR3EA5X5Y0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HTR3EA5X5Y0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HTR3EA5X5Y0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HTR3EA5X5Y0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HTR3EA5X5Y0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HTR3EA5X5Y0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HTR3EA5X5Y0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTR3EA5X5Y0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HTR3EA5X5Y0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HTR3EA5X5Y0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HTR3EA5X5Y0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HTR3EA5X5Y0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HTR3EA5X5Y0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HTR3EA5X5Y0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HTR3EA5X5Y0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HTR3EA5X5Y0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HTR3EA5X5Y0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HTR3EA5X5Y0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HTR3EA5X5Y0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HTR3EA5X5Y0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HTR3EA5X5Y0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HTR3EA5X5Y0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HTR3EA5X5Y0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HTR3EA5X5Y0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HTR3EA5X5Y0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HTR3EA5X5Y0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HTR3EA5X5Y0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HTR3EA5X5Y0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HTR3EA5X5Y0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTR3EA5X5Y0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTR3EA5X5Y0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HTR3EA5X5Y0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HTR3EA5X5Y0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTR3EA5X5Y0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTR3EA5X5Y0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTR3EA5X5Y0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTR3EA5X5Y0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HTR3EA5X5Y0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HTR3EA5X5Y0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HTR3EA5X5Y0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HTR3EA5X5Y0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HTR3EA5X5Y0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HTR3EA5X5Y0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTR3EA5X5Y0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTR3EA5X5Y0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HTR3EA5X5Y0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HTR3EA5X5Y0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HTR3EA5X5Y0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HTR3EA5X5Y0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HTR3EA5X5Y0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HTR3EA5X5Y0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HTR3EA5X5Y0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HTR3EA5X5Y0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTR3EA5X5Y0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTR3EA5X5Y0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTR3EA5X5Y0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTR3EA5X5Y0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HTR3EA5X5Y0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HTR3EA5X5Y0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HTR3EA5X5Y0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTR3EA5X5Y0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTR3EA5X5Y0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTR3EA5X5Y0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTR3EA5X5Y0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTR3EA5X5Y0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTR3EA5X5Y0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTR3EA5X5Y0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTR3EA5X5Y0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTR3EA5X5Y0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTR3EA5X5Y0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTR3EA5X5Y0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HTR3EA5X5Y0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTR3EA5X5Y0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTR3EA5X5Y0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HTR3EA5X5Y0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTR3EA5X5Y0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTR3EA5X5Y0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 414.7 ms