Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC78A2IDD5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC78A2IDD5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC78A2IDD5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC78A2IDD5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC78A2IDD5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC78A2IDD5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC78A2IDD5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC78A2IDD5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC78A2IDD5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC78A2IDD5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC78A2IDD5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC78A2IDD5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC78A2IDD5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC78A2IDD5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC78A2IDD5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC78A2IDD5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC78A2IDD5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC78A2IDD5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC78A2IDD5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC78A2IDD5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC78A2IDD5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC78A2IDD5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC78A2IDD5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC78A2IDD5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC78A2IDD5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC78A2IDD5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC78A2IDD5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC78A2IDD5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC78A2IDD5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC78A2IDD5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC78A2IDD5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC78A2IDD5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC78A2IDD5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC78A2IDD5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC78A2IDD5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC78A2IDD5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC78A2IDD5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC78A2IDD5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC78A2IDD5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC78A2IDD5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC78A2IDD5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC78A2IDD5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC78A2IDD5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC78A2IDD5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC78A2IDD5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC78A2IDD5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC78A2IDD5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC78A2IDD5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC78A2IDD5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC78A2IDD5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC78A2IDD5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC78A2IDD5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC78A2IDD5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC78A2IDD5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC78A2IDD5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC78A2IDD5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC78A2IDD5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC78A2IDD5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC78A2IDD5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC78A2IDD5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC78A2IDD5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC78A2IDD5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC78A2IDD5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC78A2IDD5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC78A2IDD5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC78A2IDD5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC78A2IDD5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC78A2IDD5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC78A2IDD5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC78A2IDD5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC78A2IDD5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC78A2IDD5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC78A2IDD5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC78A2IDD5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC78A2IDD5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC78A2IDD5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC78A2IDD5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC78A2IDD5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC78A2IDD5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC78A2IDD5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC78A2IDD5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC78A2IDD5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC78A2IDD5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC78A2IDD5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC78A2IDD5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC78A2IDD5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC78A2IDD5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC78A2IDD5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC78A2IDD5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC78A2IDD5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC78A2IDD5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC78A2IDD5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC78A2IDD5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC78A2IDD5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC78A2IDD5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC78A2IDD5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC78A2IDD5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC78A2IDD5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC78A2IDD5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms