Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPDC1A2A3K4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PTPDC1A2A3K4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
PTPDC1A2A3K4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
PTPDC1A2A3K4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PTPDC1A2A3K4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PTPDC1A2A3K4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PTPDC1A2A3K4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PTPDC1A2A3K4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTPDC1A2A3K4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTPDC1A2A3K4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTPDC1A2A3K4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTPDC1A2A3K4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTPDC1A2A3K4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPDC1A2A3K4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPDC1A2A3K4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPDC1A2A3K4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTPDC1A2A3K4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTPDC1A2A3K4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTPDC1A2A3K4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTPDC1A2A3K4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPDC1A2A3K4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PTPDC1A2A3K4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PTPDC1A2A3K4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTPDC1A2A3K4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTPDC1A2A3K4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTPDC1A2A3K4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PTPDC1A2A3K4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PTPDC1A2A3K4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PTPDC1A2A3K4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PTPDC1A2A3K4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PTPDC1A2A3K4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
PTPDC1A2A3K4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTPDC1A2A3K4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPDC1A2A3K4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPDC1A2A3K4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPDC1A2A3K4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PTPDC1A2A3K4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PTPDC1A2A3K4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PTPDC1A2A3K4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PTPDC1A2A3K4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PTPDC1A2A3K4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPDC1A2A3K4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPDC1A2A3K4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPDC1A2A3K4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PTPDC1A2A3K4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PTPDC1A2A3K4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTPDC1A2A3K4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPDC1A2A3K4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPDC1A2A3K4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTPDC1A2A3K4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PTPDC1A2A3K4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTPDC1A2A3K4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
PTPDC1A2A3K4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PTPDC1A2A3K4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPDC1A2A3K4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPDC1A2A3K4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPDC1A2A3K4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PTPDC1A2A3K4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PTPDC1A2A3K4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPDC1A2A3K4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPDC1A2A3K4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPDC1A2A3K4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPDC1A2A3K4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPDC1A2A3K4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPDC1A2A3K4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPDC1A2A3K4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPDC1A2A3K4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPDC1A2A3K4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPDC1A2A3K4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPDC1A2A3K4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPDC1A2A3K4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPDC1A2A3K4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPDC1A2A3K4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPDC1A2A3K4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPDC1A2A3K4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PTPDC1A2A3K4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPDC1A2A3K4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPDC1A2A3K4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPDC1A2A3K4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPDC1A2A3K4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPDC1A2A3K4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPDC1A2A3K4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPDC1A2A3K4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPDC1A2A3K4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPDC1A2A3K4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPDC1A2A3K4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPDC1A2A3K4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPDC1A2A3K4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPDC1A2A3K4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPDC1A2A3K4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPDC1A2A3K4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPDC1A2A3K4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPDC1A2A3K4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPDC1A2A3K4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTPDC1A2A3K4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPDC1A2A3K4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPDC1A2A3K4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPDC1A2A3K4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPDC1A2A3K4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms