Protein–RNA interactions for Protein: A1X283

SH3PXD2B, SH3 and PX domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3PXD2BA1X283 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3PXD2BA1X283 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3PXD2BA1X283 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3PXD2BA1X283 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3PXD2BA1X283 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3PXD2BA1X283 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SH3PXD2BA1X283 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH3PXD2BA1X283 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH3PXD2BA1X283 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH3PXD2BA1X283 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SH3PXD2BA1X283 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SH3PXD2BA1X283 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SH3PXD2BA1X283 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SH3PXD2BA1X283 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SH3PXD2BA1X283 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SH3PXD2BA1X283 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SH3PXD2BA1X283 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SH3PXD2BA1X283 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SH3PXD2BA1X283 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SH3PXD2BA1X283 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SH3PXD2BA1X283 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3PXD2BA1X283 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SH3PXD2BA1X283 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SH3PXD2BA1X283 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SH3PXD2BA1X283 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SH3PXD2BA1X283 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SH3PXD2BA1X283 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3PXD2BA1X283 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SH3PXD2BA1X283 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SH3PXD2BA1X283 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH3PXD2BA1X283 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH3PXD2BA1X283 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH3PXD2BA1X283 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SH3PXD2BA1X283 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SH3PXD2BA1X283 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SH3PXD2BA1X283 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SH3PXD2BA1X283 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SH3PXD2BA1X283 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SH3PXD2BA1X283 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SH3PXD2BA1X283 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SH3PXD2BA1X283 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SH3PXD2BA1X283 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SH3PXD2BA1X283 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH3PXD2BA1X283 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH3PXD2BA1X283 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH3PXD2BA1X283 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SH3PXD2BA1X283 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SH3PXD2BA1X283 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SH3PXD2BA1X283 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SH3PXD2BA1X283 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SH3PXD2BA1X283 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SH3PXD2BA1X283 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SH3PXD2BA1X283 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SH3PXD2BA1X283 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SH3PXD2BA1X283 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SH3PXD2BA1X283 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SH3PXD2BA1X283 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SH3PXD2BA1X283 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SH3PXD2BA1X283 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SH3PXD2BA1X283 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH3PXD2BA1X283 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH3PXD2BA1X283 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SH3PXD2BA1X283 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SH3PXD2BA1X283 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SH3PXD2BA1X283 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SH3PXD2BA1X283 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SH3PXD2BA1X283 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH3PXD2BA1X283 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SH3PXD2BA1X283 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH3PXD2BA1X283 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SH3PXD2BA1X283 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SH3PXD2BA1X283 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SH3PXD2BA1X283 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SH3PXD2BA1X283 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH3PXD2BA1X283 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH3PXD2BA1X283 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SH3PXD2BA1X283 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH3PXD2BA1X283 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH3PXD2BA1X283 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH3PXD2BA1X283 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH3PXD2BA1X283 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH3PXD2BA1X283 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH3PXD2BA1X283 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SH3PXD2BA1X283 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SH3PXD2BA1X283 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3PXD2BA1X283 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3PXD2BA1X283 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3PXD2BA1X283 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH3PXD2BA1X283 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH3PXD2BA1X283 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH3PXD2BA1X283 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH3PXD2BA1X283 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3PXD2BA1X283 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3PXD2BA1X283 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SH3PXD2BA1X283 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH3PXD2BA1X283 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH3PXD2BA1X283 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH3PXD2BA1X283 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH3PXD2BA1X283 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH3PXD2BA1X283 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms