Protein–RNA interactions for Protein: A0AVI4

TMEM129, E3 ubiquitin-protein ligase TM129, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM129A0AVI4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM129A0AVI4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM129A0AVI4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM129A0AVI4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM129A0AVI4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM129A0AVI4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM129A0AVI4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM129A0AVI4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM129A0AVI4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM129A0AVI4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM129A0AVI4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM129A0AVI4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM129A0AVI4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM129A0AVI4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM129A0AVI4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM129A0AVI4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM129A0AVI4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM129A0AVI4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM129A0AVI4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM129A0AVI4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM129A0AVI4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM129A0AVI4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM129A0AVI4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM129A0AVI4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM129A0AVI4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM129A0AVI4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM129A0AVI4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM129A0AVI4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM129A0AVI4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM129A0AVI4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM129A0AVI4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM129A0AVI4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM129A0AVI4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM129A0AVI4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM129A0AVI4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM129A0AVI4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM129A0AVI4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM129A0AVI4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM129A0AVI4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM129A0AVI4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM129A0AVI4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM129A0AVI4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM129A0AVI4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM129A0AVI4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM129A0AVI4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM129A0AVI4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM129A0AVI4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM129A0AVI4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM129A0AVI4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM129A0AVI4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM129A0AVI4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM129A0AVI4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM129A0AVI4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM129A0AVI4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM129A0AVI4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM129A0AVI4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM129A0AVI4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM129A0AVI4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM129A0AVI4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM129A0AVI4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM129A0AVI4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM129A0AVI4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM129A0AVI4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM129A0AVI4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM129A0AVI4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM129A0AVI4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM129A0AVI4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM129A0AVI4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM129A0AVI4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM129A0AVI4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM129A0AVI4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM129A0AVI4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM129A0AVI4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM129A0AVI4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM129A0AVI4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM129A0AVI4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM129A0AVI4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM129A0AVI4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM129A0AVI4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM129A0AVI4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM129A0AVI4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM129A0AVI4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM129A0AVI4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM129A0AVI4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM129A0AVI4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM129A0AVI4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM129A0AVI4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM129A0AVI4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM129A0AVI4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM129A0AVI4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM129A0AVI4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM129A0AVI4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM129A0AVI4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM129A0AVI4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM129A0AVI4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM129A0AVI4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM129A0AVI4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM129A0AVI4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM129A0AVI4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM129A0AVI4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms